293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4240 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 136 aa  263  5e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  90.44 
 
 		 146 aa  243  4.9999999999999997e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  71.85 
 
 		 135 aa  197  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  64.44 
 
 		 135 aa  178  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  65.93 
 
 		 135 aa  178  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  68.89 
 
 		 135 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  68.89 
 
 		 135 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  68.89 
 
 		 135 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  62.96 
 
 		 135 aa  159  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  60.74 
 
 		 135 aa  157  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 135 aa  150  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  45.59 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0370  Endoribonuclease L-PSP  48.89 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  41.91 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1769  Endoribonuclease L-PSP  45.59 
 
 		 136 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.261309 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  38.06 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  36.03 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  36.03 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  34.56 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  34.56 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  33.58 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  34.56 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  39.69 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  38.81 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  38.97 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  32.82 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  34.29 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  34.29 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1158  endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  37.68 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  40.15 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  39.26 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  42.02 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 148 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  37.31 
 
 		 402 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  36.96 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  36.3 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  37.12 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  36.79 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  36.79 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  42.34 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  39.1 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4539  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293828  normal  0.437318 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  38.35 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  38.35 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 377 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0382  endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395966  normal  0.101256 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  36.23 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  34.81 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2156  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  28.99 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0973  hypothetical protein  35.29 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  32.46 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  38.66 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  37.98 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  34.17 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6797  Endoribonuclease L-PSP  36.57 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3074  Endoribonuclease L-PSP  34.04 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0386  endoribonuclease L-PSP  50.85 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0311  Endoribonuclease L-PSP  39.62 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.480909  hitchhiker  0.000163264 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  30.6 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3401  Endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00168089  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  41.46 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3493  Endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 394 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>