More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5596 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 135 aa  276  8e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  34.35 
 
 		 135 aa  90.1  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  39.69 
 
 		 132 aa  85.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  38.52 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  32.06 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 133 aa  72  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  37.68 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  32.33 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2914  Endoribonuclease L-PSP  38.83 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000821115  hitchhiker  0.0000516213 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  40.46 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  35.61 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  29.55 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  35.94 
 
 		 402 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1787  endoribonuclease L-PSP  37.21 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  30.51 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3493  Endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  32.28 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  31.85 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  30.17 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  29.55 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0324  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3401  Endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00168089  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13810  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  36.28 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  31.54 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2796  Endoribonuclease L-PSP  40.19 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.909637  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0386  endoribonuclease L-PSP  35.58 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0973  hypothetical protein  36.04 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  33.09 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  29.63 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  29.63 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  29.63 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  28.99 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  29.63 
 
 		 146 aa  57  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  35.56 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  32.31 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  35.04 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1993  hypothetical protein  32.41 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0722461  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  36.23 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  36.23 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  36.23 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  32.09 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1027  Endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  29.01 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2305  endoribonuclease L-PSP  32.35 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220286  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4534  endoribonuclease L-PSP  32.82 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.71514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0674  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.892091 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  36.19 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1188  endoribonuclease L-PSP  30.14 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3905  Endoribonuclease L-PSP  29.37 
 
 		 164 aa  53.5  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0995322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 129 aa  52.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1769  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.261309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1661  Endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2156  Endoribonuclease L-PSP  29.77 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  38.83 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5273  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  39.33 
 
 		 128 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1357  Endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  29.2 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 128 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  31.68 
 
 		 122 aa  50.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 132 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 		 126 aa  50.4  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>