251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4539 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4539  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 142 aa  287  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293828  normal  0.437318 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2275  endoribonuclease L-PSP  62.41 
 
 		 150 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.321934  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  52.59 
 
 		 185 aa  130  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  53.73 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  53.73 
 
 		 140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  50.77 
 
 		 161 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  46.92 
 
 		 147 aa  123  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1188  endoribonuclease L-PSP  47.62 
 
 		 175 aa  117  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2405  endoribonuclease L-PSP  53.73 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.996899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2176  endoribonuclease L-PSP  41.98 
 
 		 151 aa  97.4  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589076  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0647  endoribonuclease L-PSP  39.39 
 
 		 137 aa  93.2  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  40.15 
 
 		 158 aa  90.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  39.5 
 
 		 154 aa  90.1  8e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 148 aa  84.3  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  38.06 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  37.41 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  29.77 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  28.24 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  29.23 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  28.46 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  32.09 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  29.77 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  34.56 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  36.03 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  35.2 
 
 		 510 aa  59.3  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1441  Endoribonuclease L-PSP  32.33 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6257  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5952  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0900  hypothetical protein  35.38 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5273  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  34.35 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  34.35 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  38.64 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  38.64 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  38.64 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  28.24 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4001  Endoribonuclease L-PSP  34.59 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4114  Endoribonuclease L-PSP  34.59 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1589  endoribonuclease L-PSP  29.63 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  hitchhiker  0.00909657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3094  Endoribonuclease L-PSP  33.83 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  32.33 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09920  putative translation initiation inhibitor  35.14 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00640677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  33.33 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0759  endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2367  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  34.12 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  29.32 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 126 aa  52.8  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  31.11 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  33.82 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0498  endoribonuclease L-PSP  33.82 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0754281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  30.37 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5909  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  32.59 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  29.01 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2016  endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0910058  normal  0.042718 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2796  Endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 129 aa  51.2  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.909637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  37.23 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  33.8 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25710  endoribonuclease L-PSP, putative  32.17 
 
 		 130 aa  50.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  33.91 
 
 		 128 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0780  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  30.37 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5718  Endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.698181 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4111  Endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1620  endoribonuclease L-PSP family protein  32.48 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.384169  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04792  hypothetical protein  32.35 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598375  normal  0.0238785 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  32.09 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0130  endoribonuclease L-PSP  32.2 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0429607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1720  endoribonuclease L-PSP family protein  32.48 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6227  hypothetical protein  31.2 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.138993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2117  Endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.413824 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7050  endoribonuclease L-PSP  33.98 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>