286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2275 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2275  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 150 aa  292  8e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.321934  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4539  endoribonuclease L-PSP  62.41 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293828  normal  0.437318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  54.69 
 
 		 140 aa  140  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  54.69 
 
 		 140 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  51.06 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  48.3 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1188  endoribonuclease L-PSP  51.39 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  50.75 
 
 		 185 aa  133  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2405  endoribonuclease L-PSP  54.62 
 
 		 136 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.996899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  46.92 
 
 		 147 aa  122  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2176  endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589076  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  46.09 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0647  endoribonuclease L-PSP  39.26 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  45.31 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  40.44 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  45.31 
 
 		 134 aa  85.5  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  45.31 
 
 		 134 aa  85.5  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  45.31 
 
 		 134 aa  85.5  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  41.98 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  44.12 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  36.13 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  40 
 
 		 135 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  43.09 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  37.86 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2689  hypothetical protein  40.16 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980036 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  38.97 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  34.11 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1787  endoribonuclease L-PSP  30.66 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  39.1 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  39.1 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  39.42 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  36.76 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  40.68 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6797  Endoribonuclease L-PSP  40.15 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  37.31 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  36.3 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  32.33 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  38.76 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5909  Endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  37.98 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  35.71 
 
 		 510 aa  62  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  30.53 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  38.33 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  29.77 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  43.51 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  37.59 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  37.59 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  43.51 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  37.59 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  43.51 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  29.77 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2117  Endoribonuclease L-PSP  36.15 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.413824 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  29.77 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0498  endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0754281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1589  endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  hitchhiker  0.00909657 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  30.22 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  36.84 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  38.79 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  40.2 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  32.54 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0900  hypothetical protein  35.16 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  31.85 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3094  Endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4365  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  28.79 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4114  Endoribonuclease L-PSP  38.76 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4001  Endoribonuclease L-PSP  38.76 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  36.3 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4052  Endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04792  hypothetical protein  38.76 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598375  normal  0.0238785 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>