More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0885 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 155 aa  312  9.999999999999999e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 132 aa  96.7  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  38.74 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5509  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  42.73 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  41.44 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  36.92 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  38.6 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  37.72 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  37.38 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  40.46 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  42.73 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  34.59 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  37.38 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  36.36 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4387  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70480  hypothetical protein  36.7 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  39.09 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  36.36 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1777  translation initiation inhibitor  38.74 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00398011  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  37.38 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1215  YjgF-like protein  36.36 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55454  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  36.7 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  36.61 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  35.78 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  36.36 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0410  putative endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000330558  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3633  putative endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00280207  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  38.18 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  37.84 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  33.91 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4018  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693135  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  38.39 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 122 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 126 aa  67  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 122 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  30.77 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0360  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000617851 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  37.5 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  36.75 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0352  putative endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.249855  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0350  putative endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.039857  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  34.86 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4166  putative endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04075  hypothetical protein  38.74 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4724  putative endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  37.39 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5765  putative endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>