More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0351 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 132 aa  265  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5509  endoribonuclease L-PSP  44.26 
 
 		 186 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  39.66 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  36.92 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  33.59 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  37.38 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  31.54 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  37.76 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  36.89 
 
 		 142 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  31.03 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 127 aa  67  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4111  Endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2689  hypothetical protein  32 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980036 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3553  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  31.37 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  35.56 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6227  hypothetical protein  38.46 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.138993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  35.64 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  35.56 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  34.51 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  32.04 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  35.56 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  33 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  35.56 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4432  Endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0220877  normal  0.494212 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6387  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4322  Endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366226  normal  0.0989131 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  33 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  32.2 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0668  endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  33.63 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  30.91 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  32.31 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3363  endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188913  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1148  2-aminomuconate deaminase  30.77 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0498  endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0754281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4440  endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0150272  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  29.52 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  32 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  35.63 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  33.33 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4018  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693135  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 142 aa  62  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  32.31 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0935  YjgF-like protein  32.2 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  32.31 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  34.12 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  34.12 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  26.96 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0574  putative endoribonuclease L-PSP  37 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000328511  hitchhiker  0.00876549 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  31 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3698  peptidase S1C, Do  28.71 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.239756 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  31 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  28.18 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3813  putative endoribonuclease L-PSP  34.12 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.805449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  27.91 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  29.37 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>