More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4515 on replicon NC_009669
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 137 aa  285  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  71.85 
 
 		 140 aa  217  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  73.68 
 
 		 140 aa  205  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  66.92 
 
 		 149 aa  184  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  62.22 
 
 		 139 aa  179  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  61.48 
 
 		 138 aa  179  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  62.22 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  60.74 
 
 		 138 aa  178  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  62.22 
 
 		 140 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  62.22 
 
 		 140 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 149 aa  175  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  61.48 
 
 		 145 aa  175  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  61.48 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 145 aa  174  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 138 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 145 aa  173  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6043  endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 145 aa  173  9e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143152  hitchhiker  0.000408683 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  59.26 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  59.26 
 
 		 145 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  56.93 
 
 		 136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  58.52 
 
 		 145 aa  169  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  60.47 
 
 		 130 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  58.39 
 
 		 138 aa  168  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2576  endoribonuclease L-PSP  58.65 
 
 		 139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  43.36 
 
 		 141 aa  116  9e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 377 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4018  endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693135  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1589  endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  hitchhiker  0.00909657 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  34.19 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  32.08 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  32.59 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  29.52 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  28.18 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  32.33 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  37.82 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  29.93 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  31.9 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  30.37 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2689  endoribonuclease, putative  32.94 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331269  normal  0.266918 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0498  endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 130 aa  57  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0754281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4074  endoribonuclease L-PSP  32.2 
 
 		 132 aa  57  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 126 aa  57  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  30.84 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  28.18 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0885  YjgF-like protein  31.48 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0467  endoribonuclease L-PSP  30.19 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0342744  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  25 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  33.33 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  30.91 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0878  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3063  endoribonuclease L-PSP  33.01 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.256414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  33.33 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  31.13 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0413  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  33.33 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0031  endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  32.87 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  28.95 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2126  endoribonuclease L-PSP  29.63 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.158455  hitchhiker  0.000014394 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3167  endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.552067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1345  endoribonuclease  31.13 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0475282  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>