More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1345 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1345  endoribonuclease  100 
 
 		 112 aa  231  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0475282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1019  endoribonuclease L-PSP  96.43 
 
 		 112 aa  225  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.669958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0475  endoribonuclease L-PSP  75.68 
 
 		 112 aa  186  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2171  endoribonuclease L-PSP  54.46 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  0.0971944 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2065  endoribonuclease L-PSP  54.63 
 
 		 116 aa  130  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1174  endoribonuclease L-PSP  52.68 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0413  endoribonuclease L-PSP  52.68 
 
 		 117 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0334  endoribonuclease L-PSP  52.25 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000040  endoribonuclease L-PSP family protein  52.25 
 
 		 117 aa  124  6e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2268  endoribonuclease L-PSP  52.83 
 
 		 117 aa  123  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0467  endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 		 117 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0342744  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01561  translation initiation inhibitor  50.44 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3317  hypothetical protein  49.55 
 
 		 117 aa  120  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4435  hypothetical protein  49.56 
 
 		 117 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3910  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 116 aa  120  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119462  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1019  hypothetical protein  48.65 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0961  hypothetical protein  48.65 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0466  L-PSP family endoribonuclease  51.33 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4503  endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 		 118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4149  endoribonuclease L-PSP  49.11 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3954  Endoribonuclease L-PSP  49.11 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4240  L-PSP family endoribonuclease  50.44 
 
 		 115 aa  116  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.562901  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1365  endoribonuclease L-PSP  46.85 
 
 		 114 aa  116  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.798025  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0002  putative endoribonuclease L-PSP  48.67 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149481  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3834  endoribonuclease L-PSP  48.21 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4031  endoribonuclease L-PSP  48.21 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3652  endoribonuclease L-PSP  48.21 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2376  endoribonuclease L-PSP  46.43 
 
 		 114 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337804  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4056  endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3638  endoribonuclease L-PSP  48.21 
 
 		 118 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0306  endoribonuclease L-PSP  48.21 
 
 		 118 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0809  endoribonuclease L-PSP  49.11 
 
 		 115 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2646  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.163859 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0337  translation initiation inhibitor  48.21 
 
 		 118 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2469  endoribonuclease L-PSP  44.14 
 
 		 121 aa  113  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301714  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0288  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 116 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00205912  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3201  putative endoribonuclease L-PSP family protein  47.75 
 
 		 113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0954576  normal  0.771156 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6255  Endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2297  endoribonuclease L-PSP  47.75 
 
 		 113 aa  110  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4921  endoribonuclease L-PSP  47.75 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6077  hypothetical protein  46.9 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70010  hypothetical protein  46.9 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4397  endoribonuclease L-PSP  45.22 
 
 		 120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.455291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4426  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0537399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6378  Endoribonuclease L-PSP  46.43 
 
 		 114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0807375  normal  0.458934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4948  Endoribonuclease L-PSP  46.85 
 
 		 115 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2762  endoribonuclease L-PSP  45.61 
 
 		 121 aa  106  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0236  endoribonuclease L-PSP  46.9 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2936  hypothetical protein  45.05 
 
 		 113 aa  104  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0102  endoribonuclease L-PSP family protein  47.41 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1369  hypothetical protein  47.32 
 
 		 133 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1289  Endoribonuclease L-PSP  42.34 
 
 		 120 aa  103  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2758  Endoribonuclease L-PSP  48.21 
 
 		 117 aa  102  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0992  hypothetical protein  46.36 
 
 		 114 aa  101  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0934  endoribonuclease L-PSP  46.36 
 
 		 139 aa  101  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.989038  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4474  endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2598  L-PSP family endoribonuclease  46.55 
 
 		 117 aa  100  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2329  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 127 aa  100  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1395  endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 115 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2737  putative ssRNA endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 115 aa  100  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1886  L-PSP family endoribonuclease  44.83 
 
 		 141 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1099  hypothetical protein  43.48 
 
 		 117 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130213  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0959  putative endoribonuclease L-PSP  43.48 
 
 		 117 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0541904  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1732  putative endoribonuclease L-PSP  44.83 
 
 		 117 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.125289  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0205  hypothetical protein  43.48 
 
 		 117 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197898  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1543  hypothetical protein  43.48 
 
 		 117 aa  99.4  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1708  putative endoribonuclease L-PSP  44.83 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5822  hypothetical protein  43.24 
 
 		 116 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0246  endoribonuclease L-PSP  41.59 
 
 		 116 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1775  endoribonuclease L-PSP  41.82 
 
 		 115 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.634582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67140  hypothetical protein  43.24 
 
 		 116 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0926922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1560  endoribonuclease L-PSP  44.14 
 
 		 117 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6409  endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3771  Endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 117 aa  98.2  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6642  endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6240  endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 116 aa  97.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6007  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 118 aa  97.4  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2886  Endoribonuclease L-PSP  42.34 
 
 		 114 aa  96.7  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2672  hypothetical protein  42.98 
 
 		 116 aa  96.3  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.35779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4389  Endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 119 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.276873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4020  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 119 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620706  normal  0.517505 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0653  translation inhibitor of mRNA  42.34 
 
 		 116 aa  96.7  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3393  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 116 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.308192 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0582  putative Endoribonuclease L-PSP  41.07 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2495  hypothetical protein  41.82 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0575  endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0936  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5525  endoribonuclease L-PSP  48.6 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4613  endoribonuclease L-PSP  43.36 
 
 		 117 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00014505  normal  0.903485 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2710  endoribonuclease L-PSP  42.73 
 
 		 117 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.813117 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1357  endoribonuclease L-PSP  43.36 
 
 		 117 aa  94.4  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4413  endoribonuclease L-PSP  41.59 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333895  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1158  endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0195416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1397  endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 117 aa  93.6  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0150121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47970  Endoribonuclease L-PSP family protein  43.48 
 
 		 117 aa  94  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1450  endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 117 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000258277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0990  endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 117 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00403793  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1472  endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 117 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.155856  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3455  endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2626  Endoribonuclease L-PSP  41.44 
 
 		 114 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.658895  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>