More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7162 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 131 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  94.66 
 
 		 131 aa  255  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4074  endoribonuclease L-PSP  81.54 
 
 		 132 aa  219  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  62.2 
 
 		 132 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  60.94 
 
 		 130 aa  169  9e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1589  endoribonuclease L-PSP  61.54 
 
 		 130 aa  169  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  hitchhiker  0.00909657 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4018  endoribonuclease L-PSP  60.77 
 
 		 131 aa  168  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693135  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  60.16 
 
 		 130 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  59.38 
 
 		 130 aa  166  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  60.16 
 
 		 130 aa  166  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5093  endoribonuclease L-PSP  59.23 
 
 		 132 aa  159  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0498  endoribonuclease L-PSP  60.32 
 
 		 130 aa  157  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0754281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2117  Endoribonuclease L-PSP  56.69 
 
 		 137 aa  155  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.413824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  56.15 
 
 		 132 aa  153  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  55.3 
 
 		 134 aa  150  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  53.44 
 
 		 131 aa  149  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  57.14 
 
 		 142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  52.71 
 
 		 142 aa  144  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  50.75 
 
 		 137 aa  141  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  49.23 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2689  hypothetical protein  51.94 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980036 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  54.33 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  52.38 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2178  endoribonuclease L-PSP  47.73 
 
 		 136 aa  131  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  42.31 
 
 		 133 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 133 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  39.23 
 
 		 133 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  38.76 
 
 		 143 aa  84.7  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  40.34 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 137 aa  67  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5521  Endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  35.66 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  28.24 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  35.78 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  37.98 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1397  Endoribonuclease L-PSP  28.8 
 
 		 176 aa  57  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.492198  decreased coverage  0.000402676 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  37.04 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  36.11 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  36.11 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4166  putative endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6043  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143152  hitchhiker  0.000408683 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  39 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 130 aa  52  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4019  endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 130 aa  52  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.658483  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4825  endoribonuclease L-PSP  29.32 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  28.3 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  35.19 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  35.19 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1772  Endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138497 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  34.19 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  30.7 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  35.59 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5894  Endoribonuclease L-PSP  29.55 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151505  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  38.82 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  28.91 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  30.97 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  32.03 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09123  hypothetical protein  33.63 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0574  putative endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000328511  hitchhiker  0.00876549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>