139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1772 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1772  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 130 aa  268  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138497 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5403  Endoribonuclease L-PSP  68.46 
 
 		 129 aa  181  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.411784  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3956  endoribonuclease L-PSP  61.54 
 
 		 129 aa  163  8e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6728  Endoribonuclease L-PSP  53.08 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371107 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  41.09 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  38.17 
 
 		 131 aa  90.1  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2156  Endoribonuclease L-PSP  38.17 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  38.76 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3493  Endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3401  Endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00168089  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1027  Endoribonuclease L-PSP  34.33 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  34.52 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  30.71 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  32.94 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  29.55 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  29.01 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  26.52 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  27.27 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  29.01 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4074  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 132 aa  50.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  28.79 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  28.79 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3399  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 132 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000947362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  25.95 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  32.94 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  31.06 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02980  predicted L-PSP (mRNA) endoribonuclease  25 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0590  endoribonuclease L-PSP  25 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3301  hypothetical protein  25 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0585  hypothetical protein  25 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3409  hypothetical protein  25 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3244  hypothetical protein  25 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.536174  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02931  hypothetical protein  25 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4426  hypothetical protein  25 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305727 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  32.54 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  28.18 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3587  hypothetical protein  25 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  26.36 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  27.13 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  28.41 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  25.51 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  25.51 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2117  Endoribonuclease L-PSP  26.36 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.413824 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  26.98 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  26.61 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  26.36 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  32.12 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  26.77 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  26.5 
 
 		 129 aa  45.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5093  endoribonuclease L-PSP  26.32 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4231  endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0433121  normal  0.0621047 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4816  putative endoribonuclease L-PSP  25 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2487  Endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  29.55 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2914  Endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000821115  hitchhiker  0.0000516213 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  26.92 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  26.15 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  29.93 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  31.18 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  28.18 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04111  ketoacid-binding protein  24.79 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  24.79 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4499  putative endoribonuclease L-PSP  24.79 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  24.79 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4724  putative endoribonuclease L-PSP  24.79 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04075  hypothetical protein  24.79 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  23.66 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5765  putative endoribonuclease L-PSP  24.79 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  26.72 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4840  putative endoribonuclease L-PSP  23.93 
 
 		 128 aa  43.9  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  32.93 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4114  Endoribonuclease L-PSP  30.1 
 
 		 129 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4001  Endoribonuclease L-PSP  30.1 
 
 		 129 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543856  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  25.51 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3641  endoribonuclease L-PSP family protein  28.71 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  26.98 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1589  endoribonuclease L-PSP  27.69 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  hitchhiker  0.00909657 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  28.83 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4261  endoribonuclease L-PSP  26.09 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  28.91 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  28.18 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  28.18 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  28.18 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  28.18 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0127  translation initiation inhibitor (endoribonuclease L-PSP)  26.72 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  25.64 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  24.14 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  27.27 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  28.18 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  27.27 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>