155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3956 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3956  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 129 aa  266  8e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5403  Endoribonuclease L-PSP  73.64 
 
 		 129 aa  196  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.411784  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1772  Endoribonuclease L-PSP  61.54 
 
 		 130 aa  163  8e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138497 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6728  Endoribonuclease L-PSP  57.69 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.371107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  39.23 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2156  Endoribonuclease L-PSP  39.69 
 
 		 131 aa  97.4  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 131 aa  97.1  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3401  Endoribonuclease L-PSP  37.69 
 
 		 131 aa  87.8  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00168089  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3493  Endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 		 133 aa  83.6  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1027  Endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 131 aa  62  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  27.82 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  27.82 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  27.82 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  27.82 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  29.57 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  27.69 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  28.35 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2914  Endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000821115  hitchhiker  0.0000516213 
 
 
-
 
NC_003296  RS04792  hypothetical protein  25.81 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598375  normal  0.0238785 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  29.01 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4114  Endoribonuclease L-PSP  25.78 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4001  Endoribonuclease L-PSP  25.78 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  27.13 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3399  endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 132 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000947362  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  28.87 
 
 		 126 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  26.15 
 
 		 130 aa  50.4  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  31.19 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  27.34 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  25.78 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  28.92 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  33.06 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  28.92 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4650  endoribonuclease L-PSP  30.09 
 
 		 129 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0994249  normal  0.0444369 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  28.18 
 
 		 125 aa  48.9  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4370  hypothetical protein  30.69 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3641  endoribonuclease L-PSP family protein  30 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  32.47 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  27.84 
 
 		 126 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  27.84 
 
 		 126 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  28.12 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  26.56 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1385  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6623  Endoribonuclease L-PSP  28.32 
 
 		 129 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808088  normal  0.892457 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11062  L-PSP endoribonuclease family protein Brt1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03780)  28.32 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174347  normal  0.127035 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5680  Endoribonuclease L-PSP  28.32 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.979461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 126 aa  47  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2487  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4074  endoribonuclease L-PSP  28.68 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  24.62 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2024  endoribonuclease L-PSP, putative  30.17 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  26.56 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  29.85 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  27.71 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2117  Endoribonuclease L-PSP  23.08 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.413824 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  26.56 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  26.56 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  31 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  22.31 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  30.39 
 
 		 128 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  32.93 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1266  hypothetical protein  29.76 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  25.66 
 
 		 133 aa  43.9  0.0008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  23.81 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  26.32 
 
 		 136 aa  43.9  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1470  endoribonuclease L-PSP  27.19 
 
 		 129 aa  43.5  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  27.45 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  27.45 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6248  translation initiation inhibitor  29.2 
 
 		 128 aa  42.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0971244  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  31.76 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  25.95 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3616  putative endoribonuclease L-PSP  29.57 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0327  putative endoribonuclease L-PSP  29.57 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701439  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  22.31 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  29 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  25.9 
 
 		 130 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  25.9 
 
 		 130 aa  42.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0358  endoribonuclease L-PSP, putative  29.57 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  28.95 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  28.79 
 
 		 128 aa  42  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  24.58 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  23.85 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4615  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  28.69 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3697  endoribonuclease L-PSP  34 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4550  endoribonuclease L-PSP  25.66 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>