287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2487 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2487  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 129 aa  260  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  43.2 
 
 		 135 aa  118  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  41.6 
 
 		 142 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  41.73 
 
 		 127 aa  90.1  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1464  endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 		 93 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.643404  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  32.03 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2673  Endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0780712 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  36.09 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  28.91 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 131 aa  66.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2156  Endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  36.92 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1397  Endoribonuclease L-PSP  40.31 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.492198  decreased coverage  0.000402676 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3493  Endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3401  Endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00168089  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  33.83 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  34.81 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  34.81 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  34.81 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  33.86 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  33.83 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3956  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  35.34 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1027  Endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  34.59 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  37.74 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1772  Endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138497 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5477  endoribonuclease L-PSP  44.12 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1188  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1787  endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  32.33 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2982  Endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  41.24 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  37.74 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  32.46 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  35.85 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  35.85 
 
 		 140 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2275  endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.321934  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  30.16 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  32.74 
 
 		 510 aa  51.6  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  31 
 
 		 157 aa  51.2  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  39.05 
 
 		 205 aa  51.2  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5894  Endoribonuclease L-PSP  28.12 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151505  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1385  endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5403  Endoribonuclease L-PSP  27.56 
 
 		 129 aa  50.4  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.411784  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  35.34 
 
 		 130 aa  50.4  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3756  putative mRNA endoribonuclease  39.6 
 
 		 207 aa  50.1  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  29.55 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4534  endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.71514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  28.91 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2176  endoribonuclease L-PSP  31.06 
 
 		 151 aa  48.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589076  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>