135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1464 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1464  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 93 aa  185  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.643404  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  82.8 
 
 		 142 aa  163  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  47.73 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2487  Endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  37.23 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  39.29 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  39.08 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  40.23 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  40.23 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  40.23 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  40.23 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2673  Endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0780712 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  39.08 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0702  Endoribonuclease L-PSP  39.78 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  35.63 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  36.78 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  39.08 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  37.63 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0810  endoribonuclease L-PSP  36.08 
 
 		 166 aa  50.8  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  35.29 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  34.52 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  37.5 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  34.04 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  38.3 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0673  hypothetical protein  40.51 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  36.17 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  34.57 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  38.55 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  37.23 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  36.56 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  35.63 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  34.83 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  36.17 
 
 		 130 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  33.7 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  36.14 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  35.23 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  33.72 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02286  TdcF  36.17 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  34.74 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1188  endoribonuclease L-PSP  33 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  34.83 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  33.7 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2305  endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 140 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220286  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0684  endoribonuclease L-PSP  35.44 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68249  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  34.48 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  27.96 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  31.76 
 
 		 135 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  36.14 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4539  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293828  normal  0.437318 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  32.61 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  29.03 
 
 		 205 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  32.61 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 126 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  31.52 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  32.26 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  31.76 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  32.61 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  31.76 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  32.94 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  31.52 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  33 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  31.11 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5714  endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1148  2-aminomuconate deaminase  31.33 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135879  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07405  Endoribonuclease L-PSP  36.25 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  33.72 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  31.52 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2066  Endoribonuclease L-PSP  35.62 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.582697  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  31.52 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  32.22 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  31.52 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  33.33 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1982  Endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 119 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.619306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  36.78 
 
 		 130 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>