149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02286 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02286  TdcF  100 
 
 		 155 aa  316  9e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0861  endoribonuclease L-PSP  67.79 
 
 		 164 aa  203  9e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0810  endoribonuclease L-PSP  65.31 
 
 		 166 aa  192  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1722  endoribonuclease L-PSP  51.72 
 
 		 170 aa  152  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0702  Endoribonuclease L-PSP  51.75 
 
 		 168 aa  147  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1381  endoribonuclease L-PSP  51.77 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.63415  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3006  deaminase AmnE, putative  47.33 
 
 		 144 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0930395  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2887  endoribonuclease L-PSP  46.21 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00911045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2630  endoribonuclease L-PSP  51.56 
 
 		 171 aa  121  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0084  Endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0067  Endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 244 aa  60.8  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1148  2-aminomuconate deaminase  34.78 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  26.9 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  34.06 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3200  Endoribonuclease L-PSP  28.32 
 
 		 215 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172022  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  33.33 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5211  2-aminomuconate deaminase  31.52 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236738  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3587  hypothetical protein  30.77 
 
 		 129 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02980  predicted L-PSP (mRNA) endoribonuclease  30.77 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0590  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4426  hypothetical protein  30.77 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305727 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02931  hypothetical protein  30.77 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07405  Endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3301  hypothetical protein  30.77 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0585  hypothetical protein  30.77 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3409  hypothetical protein  30.77 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3244  hypothetical protein  30.77 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.536174  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4805  putative endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4261  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4711  putative endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.31675 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4861  putative endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0127  translation initiation inhibitor (endoribonuclease L-PSP)  33.05 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0416  endoribonuclease L-PSP  27.91 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0920711 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0937  endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5203  putative 2-aminomuconate deaminase  33.33 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0761064  normal  0.126492 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2061  endoribonuclease L-PSP  29.51 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 131 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  31.78 
 
 		 131 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 125 aa  48.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  33.04 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  29.06 
 
 		 128 aa  47  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1464  endoribonuclease L-PSP  36.17 
 
 		 93 aa  47  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.643404  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3761  hypothetical protein  29.91 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1982  Endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.619306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3898  endoribonuclease L-PSP  28.26 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.216978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2009  endoribonuclease L-PSP  32.22 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.673939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  34.51 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5138  endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0310879 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 124 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1955  endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4796  hypothetical protein  33.63 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.511592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1385  endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 135 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44200  hypothetical protein  29.91 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000922317  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04111  ketoacid-binding protein  29.57 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  29.57 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  28.89 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  34.11 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1470  endoribonuclease L-PSP  27.34 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  31.16 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04075  hypothetical protein  29.57 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4499  putative endoribonuclease L-PSP  29.57 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  29.57 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6185  endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89906  normal  0.555721 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  30.99 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0445  putative endoribonuclease L-PSP  32.97 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.013198 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2094  hypothetical protein  31.3 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4816  putative endoribonuclease L-PSP  29.57 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1158  endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0195416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5765  putative endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1878  endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4724  putative endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4840  putative endoribonuclease L-PSP  28.7 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  30.08 
 
 		 132 aa  44.3  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 127 aa  44.3  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  30.28 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  27.41 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3266  endoribonuclease L-PSP  30.69 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  27.34 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>