More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5138 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5138  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 140 aa  288  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0310879 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0684  endoribonuclease L-PSP  80.74 
 
 		 138 aa  236  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5211  2-aminomuconate deaminase  73.38 
 
 		 145 aa  223  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236738  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7642  endoribonuclease L-PSP  74.26 
 
 		 143 aa  216  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.882993 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1470  Endoribonuclease L-PSP  71.43 
 
 		 143 aa  210  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2009  endoribonuclease L-PSP  71.64 
 
 		 143 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.673939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1148  2-aminomuconate deaminase  69.85 
 
 		 145 aa  208  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1409  endoribonuclease L-PSP  70.9 
 
 		 142 aa  208  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5501  endoribonuclease L-PSP  66.91 
 
 		 143 aa  205  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9111  endoribonuclease L-PSP  67.94 
 
 		 140 aa  197  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3898  endoribonuclease L-PSP  66.42 
 
 		 142 aa  195  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.216978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3523  endoribonuclease L-PSP  65.93 
 
 		 154 aa  191  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07405  Endoribonuclease L-PSP  64.03 
 
 		 141 aa  191  4e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3522  endoribonuclease L-PSP  62.6 
 
 		 143 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1831  putative 2-aminomuconate deaminase  40.46 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 128 aa  86.7  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  38.06 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  40.34 
 
 		 126 aa  83.6  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  32.85 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 125 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5203  putative 2-aminomuconate deaminase  35.88 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0761064  normal  0.126492 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 126 aa  80.1  0.000000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  33.83 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  35.77 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 123 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  34.71 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  42.68 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  35.54 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  37.98 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  38.33 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  36.22 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  43.04 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  34.15 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 128 aa  72  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  32.35 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  32.31 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  36.36 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4261  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  31.06 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  32.82 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04783  hypothetical protein  34.78 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05655  hypothetical protein  34.78 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  32.77 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  37.59 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  34.15 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  41.54 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  37.21 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1053  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 121 aa  70.1  0.000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  33.07 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  39.51 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1208  putative endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  35.82 
 
 		 129 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  34.15 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  38.66 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  32.5 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  43.04 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  31.85 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0317  putative endoribonuclease L-PSP  43.59 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  33.08 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  33.58 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3491  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.444346  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>