More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3898 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3898  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 142 aa  288  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.216978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3523  endoribonuclease L-PSP  92.81 
 
 		 154 aa  265  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9111  endoribonuclease L-PSP  71.85 
 
 		 140 aa  206  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1409  endoribonuclease L-PSP  71.43 
 
 		 142 aa  203  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5501  endoribonuclease L-PSP  67.88 
 
 		 143 aa  199  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1470  Endoribonuclease L-PSP  67.67 
 
 		 143 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5211  2-aminomuconate deaminase  70.99 
 
 		 145 aa  199  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236738  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7642  endoribonuclease L-PSP  68.42 
 
 		 143 aa  196  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.882993 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5138  endoribonuclease L-PSP  66.42 
 
 		 140 aa  195  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0310879 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0684  endoribonuclease L-PSP  67.16 
 
 		 138 aa  193  6e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1148  2-aminomuconate deaminase  65.65 
 
 		 145 aa  183  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2009  endoribonuclease L-PSP  66.17 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.673939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07405  Endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 141 aa  177  4e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3522  endoribonuclease L-PSP  64.39 
 
 		 143 aa  176  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1831  putative 2-aminomuconate deaminase  40.46 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 124 aa  83.6  9e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  35.83 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  35.46 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  34.11 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 127 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5203  putative 2-aminomuconate deaminase  34.09 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0761064  normal  0.126492 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  27.82 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  31.09 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  29.77 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  36.75 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  30.37 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  40.51 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  37.27 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  29.55 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  32.09 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  31.67 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  40.79 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1208  putative endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  33.33 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5909  Endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  34.09 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  30.25 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  37.07 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3094  Endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2337  putative endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  34.59 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 120 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  29.17 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  29.17 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  35.44 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1345  endoribonuclease  32.56 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0475282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  29.01 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  32.84 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0317  putative endoribonuclease L-PSP  36.71 
 
 		 84 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0900  hypothetical protein  31.15 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  31.93 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  33.61 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  32.52 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  32.52 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02980  predicted L-PSP (mRNA) endoribonuclease  26.47 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0590  endoribonuclease L-PSP  26.47 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0585  hypothetical protein  26.47 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4426  hypothetical protein  26.47 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305727 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  27.83 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3301  hypothetical protein  26.47 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  35.8 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1878  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1019  endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.669958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3409  hypothetical protein  26.47 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02931  hypothetical protein  26.47 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  37.21 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3244  hypothetical protein  26.47 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.536174  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>