More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3522 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3522  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 143 aa  290  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1470  Endoribonuclease L-PSP  71.76 
 
 		 143 aa  202  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7642  endoribonuclease L-PSP  70.23 
 
 		 143 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.882993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9111  endoribonuclease L-PSP  69.4 
 
 		 140 aa  197  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5501  endoribonuclease L-PSP  70.99 
 
 		 143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5211  2-aminomuconate deaminase  68.15 
 
 		 145 aa  191  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236738  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1148  2-aminomuconate deaminase  69.47 
 
 		 145 aa  191  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1409  endoribonuclease L-PSP  68.7 
 
 		 142 aa  190  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0684  endoribonuclease L-PSP  65.65 
 
 		 138 aa  189  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07405  Endoribonuclease L-PSP  63.91 
 
 		 141 aa  181  3e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5138  endoribonuclease L-PSP  62.6 
 
 		 140 aa  181  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0310879 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3898  endoribonuclease L-PSP  64.39 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.216978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3523  endoribonuclease L-PSP  63.64 
 
 		 154 aa  176  9e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2009  endoribonuclease L-PSP  62.6 
 
 		 143 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.673939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1831  putative 2-aminomuconate deaminase  42.75 
 
 		 132 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5203  putative 2-aminomuconate deaminase  40.15 
 
 		 147 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0761064  normal  0.126492 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  41.44 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  35.9 
 
 		 132 aa  77.8  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  30.37 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  32.31 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  35.46 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  33.33 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04783  hypothetical protein  35.65 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05655  hypothetical protein  35.65 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  39.51 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  35.54 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  33.33 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  41.46 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  47.06 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  31.3 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  37.27 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  42.68 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  43.21 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  32.17 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  41.98 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  33.06 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  40.7 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5110  endoribonuclease L-PSP  35.79 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123544  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  46.15 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  40.51 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  34.68 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04590  endoribonuclease L-PSP, putative  34.65 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  42.7 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  29.46 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  29.46 
 
 		 130 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  33.64 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  30.08 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  40.24 
 
 		 130 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  28.68 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  36.92 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  38.27 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  38.27 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  38.27 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  38.27 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  31.93 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  38.27 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  38.27 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  43.21 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.594587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>