More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3523 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3523  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 154 aa  312  9e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3898  endoribonuclease L-PSP  92.81 
 
 		 142 aa  265  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.216978 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9111  endoribonuclease L-PSP  74.07 
 
 		 140 aa  207  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1470  Endoribonuclease L-PSP  69.92 
 
 		 143 aa  205  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1409  endoribonuclease L-PSP  68.57 
 
 		 142 aa  202  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7642  endoribonuclease L-PSP  69.17 
 
 		 143 aa  201  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.882993 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5211  2-aminomuconate deaminase  71.76 
 
 		 145 aa  197  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236738  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5501  endoribonuclease L-PSP  68.66 
 
 		 143 aa  193  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5138  endoribonuclease L-PSP  65.93 
 
 		 140 aa  191  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0310879 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0684  endoribonuclease L-PSP  65.67 
 
 		 138 aa  191  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2009  endoribonuclease L-PSP  68.42 
 
 		 143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.673939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1148  2-aminomuconate deaminase  63.5 
 
 		 145 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135879  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07405  Endoribonuclease L-PSP  64.44 
 
 		 141 aa  178  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3522  endoribonuclease L-PSP  63.64 
 
 		 143 aa  176  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1831  putative 2-aminomuconate deaminase  41.98 
 
 		 132 aa  100  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 123 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5203  putative 2-aminomuconate deaminase  34.85 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0761064  normal  0.126492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  32.77 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  29.32 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  41.98 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  29.77 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  31.93 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 134 aa  70.1  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  31.06 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  30.15 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  34.17 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  27.41 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  40.51 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  26.83 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  30.36 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  26.83 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  30.33 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  30.83 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  33.08 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  29.77 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  32.41 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  29.17 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  32.77 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  29.17 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  30.63 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5110  endoribonuclease L-PSP  35.79 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.123544  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  27.5 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3094  Endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05611  YjgF family translation initiation inhibitor  33.61 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  29.01 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  27.83 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  35.56 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  34.45 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5909  Endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1208  putative endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 117 aa  62  0.000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3741  endoribonuclease L-PSP  39.51 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0317  putative endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 84 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2337  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  32.14 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1878  endoribonuclease L-PSP  36.52 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  29.17 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0900  hypothetical protein  31.4 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  35.44 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  38.67 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1345  endoribonuclease  32.56 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0475282  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5489  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  29.09 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  38.46 
 
 		 156 aa  60.1  0.000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  33.33 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1019  endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.669958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  36.71 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>