More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07405 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_07405  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 141 aa  293  5e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5501  endoribonuclease L-PSP  68.09 
 
 		 143 aa  202  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5211  2-aminomuconate deaminase  68.61 
 
 		 145 aa  199  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236738  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1470  Endoribonuclease L-PSP  64.58 
 
 		 143 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0684  endoribonuclease L-PSP  64.49 
 
 		 138 aa  195  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1409  endoribonuclease L-PSP  66.18 
 
 		 142 aa  194  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7642  endoribonuclease L-PSP  65.67 
 
 		 143 aa  193  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.882993 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5138  endoribonuclease L-PSP  64.03 
 
 		 140 aa  191  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0310879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9111  endoribonuclease L-PSP  65.67 
 
 		 140 aa  187  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3522  endoribonuclease L-PSP  63.91 
 
 		 143 aa  181  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1148  2-aminomuconate deaminase  60 
 
 		 145 aa  180  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3523  endoribonuclease L-PSP  64.44 
 
 		 154 aa  178  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3898  endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.216978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2009  endoribonuclease L-PSP  60.14 
 
 		 143 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.673939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1831  putative 2-aminomuconate deaminase  48.48 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  40.83 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  41.8 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  39.52 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  40.48 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  34.96 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  35.56 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  39.67 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5203  putative 2-aminomuconate deaminase  36.36 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0761064  normal  0.126492 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  33.33 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  39.83 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  33.58 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  35.56 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  31.65 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  32.62 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  35 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.14391 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  37.19 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  34.92 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 125 aa  73.6  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  37.3 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  30.43 
 
 		 130 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  36.03 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  31.88 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  37.3 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  36.89 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  39.67 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  36.51 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0935  YjgF-like protein  34.11 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  34.4 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  38.52 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  31.85 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  37.3 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  36.5 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  34.43 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04783  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05655  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  33.59 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  33.58 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  46.25 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  36.51 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02980  predicted L-PSP (mRNA) endoribonuclease  29.41 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0590  endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3244  hypothetical protein  29.41 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.536174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4426  hypothetical protein  29.41 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305727 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  31.45 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0585  hypothetical protein  29.41 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  37.31 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02931  hypothetical protein  29.41 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3409  hypothetical protein  29.41 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3301  hypothetical protein  29.41 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  42.5 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1053  endoribonuclease L-PSP  39.68 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2792  putative endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  43.37 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>