More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9111 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9111  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 140 aa  285  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1470  Endoribonuclease L-PSP  76.3 
 
 		 143 aa  225  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7642  endoribonuclease L-PSP  76.3 
 
 		 143 aa  223  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.882993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3523  endoribonuclease L-PSP  74.07 
 
 		 154 aa  207  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3898  endoribonuclease L-PSP  71.85 
 
 		 142 aa  206  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.216978 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5211  2-aminomuconate deaminase  71.85 
 
 		 145 aa  205  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236738  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1409  endoribonuclease L-PSP  68.89 
 
 		 142 aa  202  9e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5501  endoribonuclease L-PSP  68.35 
 
 		 143 aa  202  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0684  endoribonuclease L-PSP  69.47 
 
 		 138 aa  200  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5138  endoribonuclease L-PSP  67.94 
 
 		 140 aa  197  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0310879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3522  endoribonuclease L-PSP  69.4 
 
 		 143 aa  197  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1148  2-aminomuconate deaminase  67.41 
 
 		 145 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2009  endoribonuclease L-PSP  67.18 
 
 		 143 aa  189  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.673939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07405  Endoribonuclease L-PSP  65.67 
 
 		 141 aa  187  2.9999999999999997e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1831  putative 2-aminomuconate deaminase  42.86 
 
 		 132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  39.17 
 
 		 135 aa  84  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5203  putative 2-aminomuconate deaminase  37.12 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0761064  normal  0.126492 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 129 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  36.76 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  35.77 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  35.61 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  32.54 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  38.33 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  34.81 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  33.88 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0664  endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  34.81 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  34.11 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  33.58 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  35.77 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  36.15 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  39.5 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  32.26 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2962  endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  33.82 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  35.77 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  37.12 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  34.11 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  35.82 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  32.59 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  38.33 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  34.81 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 125 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  31.71 
 
 		 125 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04783  hypothetical protein  33.04 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05655  hypothetical protein  33.04 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  34.15 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1554  putative endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 128 aa  72  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  40.18 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  36.97 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4365  endoribonuclease L-PSP  37.3 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  33.09 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  31.06 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  43.21 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  32.35 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  34.33 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  43.04 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1053  endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  36.8 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  45.57 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  36.75 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  34.06 
 
 		 131 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  34.06 
 
 		 131 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  32.59 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  32.35 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0701  putative endoribonuclease L-PSP  41.03 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>