More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5501 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5501  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 143 aa  299  8.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1409  endoribonuclease L-PSP  75 
 
 		 142 aa  221  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0684  endoribonuclease L-PSP  70.07 
 
 		 138 aa  216  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1470  Endoribonuclease L-PSP  73.88 
 
 		 143 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1148  2-aminomuconate deaminase  71.53 
 
 		 145 aa  207  5e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5138  endoribonuclease L-PSP  66.91 
 
 		 140 aa  205  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0310879 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5211  2-aminomuconate deaminase  68.35 
 
 		 145 aa  204  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236738  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7642  endoribonuclease L-PSP  70.9 
 
 		 143 aa  202  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.882993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9111  endoribonuclease L-PSP  68.35 
 
 		 140 aa  202  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07405  Endoribonuclease L-PSP  68.09 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3898  endoribonuclease L-PSP  67.88 
 
 		 142 aa  199  9e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.216978 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3522  endoribonuclease L-PSP  70.99 
 
 		 143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3523  endoribonuclease L-PSP  68.66 
 
 		 154 aa  193  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2009  endoribonuclease L-PSP  65.44 
 
 		 143 aa  186  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.673939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1831  putative 2-aminomuconate deaminase  38.93 
 
 		 132 aa  103  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  38.58 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  35.56 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  36.57 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  36.09 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2029  putative endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0480857  normal  0.0222602 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04783  hypothetical protein  36.52 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05655  hypothetical protein  36.52 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  38.84 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  41.77 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  34.82 
 
 		 128 aa  73.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  42.57 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  44.58 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  31.71 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0935  YjgF-like protein  38.21 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  35.83 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  31.06 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2754  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  31.71 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  31.67 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  32.09 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  39.18 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 123 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00762  endoribonuclease L-PSP family protein  31.85 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  33.06 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  35.65 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1053  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  35.14 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5203  putative 2-aminomuconate deaminase  32.82 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0761064  normal  0.126492 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  47.76 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  36.69 
 
 		 134 aa  67  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  35.25 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  31.39 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  31.09 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  35.45 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  33.64 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  44.78 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  34.68 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  33.06 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1845  endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0574701  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  45 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>