More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3094 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3094  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 134 aa  273  8e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.152732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0900  hypothetical protein  89.55 
 
 		 134 aa  244  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5909  Endoribonuclease L-PSP  62.69 
 
 		 134 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6195  Endoribonuclease L-PSP  59.23 
 
 		 138 aa  160  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393332  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04792  hypothetical protein  58.33 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.598375  normal  0.0238785 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4001  Endoribonuclease L-PSP  56.67 
 
 		 129 aa  147  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.543856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4114  Endoribonuclease L-PSP  56.67 
 
 		 129 aa  147  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0972  endoribonuclease L-PSP  61.21 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4370  hypothetical protein  51.24 
 
 		 140 aa  127  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5483  endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.387695 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4365  endoribonuclease L-PSP  54.39 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3641  endoribonuclease L-PSP family protein  50.44 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3399  endoribonuclease L-PSP  49.55 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000947362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4818  endoribonuclease L-PSP  51.35 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3697  endoribonuclease L-PSP  48.65 
 
 		 130 aa  110  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  42.34 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 128 aa  89.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 126 aa  89.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0835  endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 125 aa  88.6  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  41.51 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 126 aa  86.7  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 126 aa  86.7  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 123 aa  87  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  38.74 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1473  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0264  putative endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 122 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 126 aa  83.6  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0268  cell division protein FtsY  38.39 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.279233  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0419  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.707513  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0463  endoribonuclease L-PSP  37.3 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1452  L-PSP family endoribonuclease  31.3 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0104737  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4146  endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.126381  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00156  Endoribonuclease L-PSP family protein  35.85 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  35.09 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  35.09 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  35.09 
 
 		 127 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  30.71 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  33.02 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  33.02 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  32.2 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  30.91 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  31.82 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  30.63 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 120 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2433  Endoribonuclease L-PSP  30.63 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000552241  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  32.11 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11062  L-PSP endoribonuclease family protein Brt1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03780)  29.36 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174347  normal  0.127035 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09080  L-PSP endoribonuclease family protein (Hmf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02340)  32.14 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1208  putative endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 117 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  28.83 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  35.78 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  34.23 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  32.11 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  30.63 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4710  endoribonuclease L-PSP  33 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0704377  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51902  maintenance of mitochondrial DNA  35.29 
 
 		 109 aa  71.2  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  30.28 
 
 		 120 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  32.08 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1148  2-aminomuconate deaminase  34.15 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>