More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_44200 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_44200  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  239  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000922317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3761  hypothetical protein  97.44 
 
 		 117 aa  235  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0246  endoribonuclease L-PSP  50.43 
 
 		 116 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47970  Endoribonuclease L-PSP family protein  52.14 
 
 		 117 aa  117  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2329  endoribonuclease L-PSP  51.79 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2759  hypothetical protein  49.15 
 
 		 119 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1369  hypothetical protein  46.09 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01773  endoribonuclease L-PSP family  45.54 
 
 		 115 aa  111  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1242  hypothetical protein  45.54 
 
 		 114 aa  110  6e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0288  endoribonuclease L-PSP  46.43 
 
 		 116 aa  110  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00205912  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1150  endoribonuclease L-PSP  45.54 
 
 		 114 aa  110  6e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.710558  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3771  Endoribonuclease L-PSP  44.25 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1560  endoribonuclease L-PSP  46.09 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1708  putative endoribonuclease L-PSP  43.48 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0413  endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1886  L-PSP family endoribonuclease  42.61 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2598  L-PSP family endoribonuclease  43.48 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2758  Endoribonuclease L-PSP  45.22 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1732  putative endoribonuclease L-PSP  42.61 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.125289  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1099  hypothetical protein  42.61 
 
 		 117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130213  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0205  hypothetical protein  42.61 
 
 		 117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197898  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0959  putative endoribonuclease L-PSP  42.61 
 
 		 117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0541904  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1543  hypothetical protein  42.61 
 
 		 117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2929  Endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 115 aa  107  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2171  endoribonuclease L-PSP  46.43 
 
 		 117 aa  107  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  0.0971944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2376  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 114 aa  107  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337804  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0653  translation inhibitor of mRNA  42.34 
 
 		 116 aa  107  7.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6409  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 131 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6642  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 131 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0102  endoribonuclease L-PSP family protein  43.59 
 
 		 117 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6240  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0467  endoribonuclease L-PSP  45.61 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0342744  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0236  endoribonuclease L-PSP  43.59 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3317  hypothetical protein  43.48 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6077  hypothetical protein  44.44 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3393  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 116 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.308192 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70010  hypothetical protein  44.44 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0334  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4056  endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4435  hypothetical protein  42.61 
 
 		 117 aa  103  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4149  endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 120 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4613  endoribonuclease L-PSP  43.48 
 
 		 117 aa  103  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00014505  normal  0.903485 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3954  Endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 117 aa  103  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3638  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 118 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0306  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 118 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01561  translation initiation inhibitor  43.86 
 
 		 118 aa  104  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4031  endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 117 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1357  endoribonuclease L-PSP  43.48 
 
 		 117 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3834  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 118 aa  103  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1781  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 140 aa  103  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1397  endoribonuclease L-PSP  43.48 
 
 		 117 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0150121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1174  endoribonuclease L-PSP  43.48 
 
 		 114 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1450  endoribonuclease L-PSP  43.48 
 
 		 117 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000258277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0990  endoribonuclease L-PSP  43.48 
 
 		 117 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00403793  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1472  endoribonuclease L-PSP  43.48 
 
 		 117 aa  102  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.155856  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0337  translation initiation inhibitor  42.11 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3652  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2268  endoribonuclease L-PSP  43.36 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4336  endoribonuclease L-PSP  41.59 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.597458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2495  hypothetical protein  44.64 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3201  putative endoribonuclease L-PSP family protein  46.43 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0954576  normal  0.771156 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0691  Endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 116 aa  100  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3455  endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 117 aa  100  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0961  hypothetical protein  41.23 
 
 		 114 aa  99.8  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1019  hypothetical protein  41.23 
 
 		 114 aa  99.8  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4503  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 118 aa  99.8  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259077  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4240  L-PSP family endoribonuclease  43.75 
 
 		 115 aa  98.6  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.562901  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3910  endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 116 aa  98.6  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4265  Endoribonuclease L-PSP  43.86 
 
 		 116 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4502  Endoribonuclease L-PSP  42.24 
 
 		 119 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.654756 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4389  Endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 		 119 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.276873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4020  endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 		 119 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620706  normal  0.517505 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0466  L-PSP family endoribonuclease  42.11 
 
 		 117 aa  97.1  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6378  Endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 114 aa  97.1  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0807375  normal  0.458934 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1365  endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 114 aa  97.1  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.798025  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2065  endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 		 116 aa  96.7  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5525  endoribonuclease L-PSP  44.76 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4921  endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 115 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4948  Endoribonuclease L-PSP  41.23 
 
 		 115 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2622  endoribonuclease L-PSP  45.22 
 
 		 116 aa  95.9  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1162  hypothetical protein  42.98 
 
 		 120 aa  95.1  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0809  endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 115 aa  95.1  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2672  hypothetical protein  37.93 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.35779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0936  endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 		 118 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1575  hypothetical protein  39.13 
 
 		 131 aa  94  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0002  putative endoribonuclease L-PSP  41.96 
 
 		 115 aa  94  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149481  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2886  Endoribonuclease L-PSP  39.47 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2737  putative ssRNA endoribonuclease L-PSP  40.18 
 
 		 115 aa  93.6  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1395  endoribonuclease L-PSP  40.18 
 
 		 115 aa  93.6  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1273  endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0475  endoribonuclease L-PSP  40.18 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6007  endoribonuclease L-PSP  41.74 
 
 		 118 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2469  endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301714  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2936  hypothetical protein  38.6 
 
 		 113 aa  92  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4474  endoribonuclease L-PSP  37.39 
 
 		 117 aa  92.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2018  endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 114 aa  92  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.711263  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4413  endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333895  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2129  endoribonuclease L-PSP  38.6 
 
 		 114 aa  92  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2407  hypothetical protein  38.6 
 
 		 114 aa  92  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000841178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1158  endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 120 aa  91.3  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0195416  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>