More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2672 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2672  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  236  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.35779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0936  endoribonuclease L-PSP  64.66 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4389  Endoribonuclease L-PSP  59.48 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.276873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4020  endoribonuclease L-PSP  59.48 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620706  normal  0.517505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4502  Endoribonuclease L-PSP  61.21 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.654756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4948  Endoribonuclease L-PSP  64.35 
 
 		 115 aa  146  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4921  endoribonuclease L-PSP  64.35 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2026  endoribonuclease L-PSP  62.39 
 
 		 118 aa  143  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.232751  normal  0.248157 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2376  endoribonuclease L-PSP  58.62 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337804  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3910  endoribonuclease L-PSP  58.77 
 
 		 116 aa  142  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1365  endoribonuclease L-PSP  59.13 
 
 		 114 aa  139  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.798025  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1019  hypothetical protein  58.26 
 
 		 114 aa  138  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0961  hypothetical protein  58.26 
 
 		 114 aa  138  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0334  endoribonuclease L-PSP  57.39 
 
 		 114 aa  135  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0809  endoribonuclease L-PSP  56.9 
 
 		 115 aa  135  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2886  Endoribonuclease L-PSP  57.39 
 
 		 114 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1174  endoribonuclease L-PSP  57.76 
 
 		 114 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2936  hypothetical protein  57.39 
 
 		 113 aa  131  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2626  Endoribonuclease L-PSP  55.65 
 
 		 114 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.658895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2065  endoribonuclease L-PSP  58.72 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1708  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1781  endoribonuclease L-PSP  51.72 
 
 		 140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4474  endoribonuclease L-PSP  53.45 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2737  putative ssRNA endoribonuclease L-PSP  57.14 
 
 		 115 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4503  endoribonuclease L-PSP  51.72 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2171  endoribonuclease L-PSP  52.63 
 
 		 117 aa  124  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  0.0971944 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0467  endoribonuclease L-PSP  51.72 
 
 		 117 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0342744  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2598  L-PSP family endoribonuclease  50 
 
 		 117 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0466  L-PSP family endoribonuclease  50.86 
 
 		 117 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1886  L-PSP family endoribonuclease  49.14 
 
 		 141 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1732  putative endoribonuclease L-PSP  49.14 
 
 		 117 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.125289  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1099  hypothetical protein  49.14 
 
 		 117 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130213  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0959  putative endoribonuclease L-PSP  49.14 
 
 		 117 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0541904  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01773  endoribonuclease L-PSP family  53.1 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0205  hypothetical protein  49.14 
 
 		 117 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197898  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1543  hypothetical protein  49.14 
 
 		 117 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0337  translation initiation inhibitor  51.3 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0102  endoribonuclease L-PSP family protein  59.83 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1150  endoribonuclease L-PSP  55.75 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.710558  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1242  hypothetical protein  55.75 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3834  endoribonuclease L-PSP  52.17 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3954  Endoribonuclease L-PSP  52.17 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4149  endoribonuclease L-PSP  52.17 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3771  Endoribonuclease L-PSP  49.57 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1395  endoribonuclease L-PSP  56.25 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0306  endoribonuclease L-PSP  51.3 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3393  endoribonuclease L-PSP  52.17 
 
 		 116 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.308192 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0288  endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 		 116 aa  120  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00205912  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3652  endoribonuclease L-PSP  52.17 
 
 		 117 aa  120  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1397  endoribonuclease L-PSP  50.86 
 
 		 117 aa  120  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0150121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1450  endoribonuclease L-PSP  50.86 
 
 		 117 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000258277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0990  endoribonuclease L-PSP  50.86 
 
 		 117 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00403793  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3638  endoribonuclease L-PSP  51.3 
 
 		 118 aa  120  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1472  endoribonuclease L-PSP  50.86 
 
 		 117 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.155856  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4613  endoribonuclease L-PSP  50.86 
 
 		 117 aa  120  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00014505  normal  0.903485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2758  Endoribonuclease L-PSP  51.72 
 
 		 117 aa  120  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6409  endoribonuclease L-PSP  53.1 
 
 		 131 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1357  endoribonuclease L-PSP  50.86 
 
 		 117 aa  120  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6642  endoribonuclease L-PSP  53.1 
 
 		 131 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6240  endoribonuclease L-PSP  52.17 
 
 		 116 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1369  hypothetical protein  50 
 
 		 133 aa  120  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0236  endoribonuclease L-PSP  57.26 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1560  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1775  endoribonuclease L-PSP  55.36 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.634582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1273  endoribonuclease L-PSP  49.56 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4056  endoribonuclease L-PSP  51.3 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4031  endoribonuclease L-PSP  51.3 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2759  hypothetical protein  49.58 
 
 		 119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0575  endoribonuclease L-PSP  45.22 
 
 		 125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0246  endoribonuclease L-PSP  51.72 
 
 		 116 aa  117  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6077  hypothetical protein  54.31 
 
 		 117 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70010  hypothetical protein  54.31 
 
 		 117 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4240  L-PSP family endoribonuclease  50 
 
 		 115 aa  117  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.562901  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3317  hypothetical protein  48.28 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1158  endoribonuclease L-PSP  48.25 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0195416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0653  translation inhibitor of mRNA  44.64 
 
 		 116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47970  Endoribonuclease L-PSP family protein  52.59 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4900  Endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3823  Endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0413  endoribonuclease L-PSP  46.96 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2329  endoribonuclease L-PSP  45.61 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4265  Endoribonuclease L-PSP  51.3 
 
 		 116 aa  110  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2268  endoribonuclease L-PSP  46.96 
 
 		 117 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000040  endoribonuclease L-PSP family protein  47.37 
 
 		 117 aa  110  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1575  hypothetical protein  46.49 
 
 		 131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2764  endoribonuclease L-PSP  47.83 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0880096  normal  0.0168064 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6007  endoribonuclease L-PSP  52.14 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4372  endoribonuclease L-PSP  49.12 
 
 		 117 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4397  endoribonuclease L-PSP  46.55 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.455291 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7057  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945657  normal  0.394054 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1979  Endoribonuclease L-PSP  46.55 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01561  translation initiation inhibitor  45.69 
 
 		 118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2407  hypothetical protein  47.83 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000841178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2018  endoribonuclease L-PSP  47.83 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.711263  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2129  endoribonuclease L-PSP  47.83 
 
 		 114 aa  107  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0992  hypothetical protein  49.12 
 
 		 114 aa  107  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0934  endoribonuclease L-PSP  49.12 
 
 		 139 aa  107  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.989038  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1889  Endoribonuclease L-PSP  50.86 
 
 		 117 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121968  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1649  Endoribonuclease L-PSP  45.69 
 
 		 122 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.123115 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0063  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.819868  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>