More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4948 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4948  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 115 aa  228  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4921  endoribonuclease L-PSP  89.57 
 
 		 115 aa  205  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4389  Endoribonuclease L-PSP  66.95 
 
 		 119 aa  147  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.276873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4020  endoribonuclease L-PSP  66.95 
 
 		 119 aa  147  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620706  normal  0.517505 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2672  hypothetical protein  64.35 
 
 		 116 aa  146  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.35779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2376  endoribonuclease L-PSP  61.4 
 
 		 114 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337804  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0466  L-PSP family endoribonuclease  61.4 
 
 		 117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3317  hypothetical protein  59.83 
 
 		 117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4502  Endoribonuclease L-PSP  65.25 
 
 		 119 aa  144  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.654756 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3954  Endoribonuclease L-PSP  60.53 
 
 		 117 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4149  endoribonuclease L-PSP  60.53 
 
 		 120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4056  endoribonuclease L-PSP  60.53 
 
 		 120 aa  143  9e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3652  endoribonuclease L-PSP  60.53 
 
 		 117 aa  143  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0337  translation initiation inhibitor  59.65 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2026  endoribonuclease L-PSP  67.24 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.232751  normal  0.248157 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0334  endoribonuclease L-PSP  62.83 
 
 		 114 aa  142  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3638  endoribonuclease L-PSP  59.65 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3910  endoribonuclease L-PSP  63.96 
 
 		 116 aa  142  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0809  endoribonuclease L-PSP  63.72 
 
 		 115 aa  142  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4503  endoribonuclease L-PSP  60.53 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0306  endoribonuclease L-PSP  59.65 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3834  endoribonuclease L-PSP  59.65 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4031  endoribonuclease L-PSP  59.65 
 
 		 117 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4474  endoribonuclease L-PSP  64.1 
 
 		 117 aa  141  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0936  endoribonuclease L-PSP  64.35 
 
 		 118 aa  140  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1174  endoribonuclease L-PSP  63.72 
 
 		 114 aa  140  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0467  endoribonuclease L-PSP  58.97 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0342744  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0288  endoribonuclease L-PSP  58.26 
 
 		 116 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00205912  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1019  hypothetical protein  61.06 
 
 		 114 aa  138  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0961  hypothetical protein  61.06 
 
 		 114 aa  138  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2065  endoribonuclease L-PSP  65.74 
 
 		 116 aa  137  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0413  endoribonuclease L-PSP  56.14 
 
 		 117 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0102  endoribonuclease L-PSP family protein  63.48 
 
 		 117 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2936  hypothetical protein  58.93 
 
 		 113 aa  136  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2268  endoribonuclease L-PSP  59.65 
 
 		 117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2886  Endoribonuclease L-PSP  55.36 
 
 		 114 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2171  endoribonuclease L-PSP  57.52 
 
 		 117 aa  133  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  0.0971944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0236  endoribonuclease L-PSP  60.87 
 
 		 117 aa  133  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4240  L-PSP family endoribonuclease  60.18 
 
 		 115 aa  132  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.562901  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6077  hypothetical protein  61.74 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1395  endoribonuclease L-PSP  60.91 
 
 		 115 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70010  hypothetical protein  61.74 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2626  Endoribonuclease L-PSP  54.46 
 
 		 114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.658895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1365  endoribonuclease L-PSP  58.41 
 
 		 114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.798025  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0002  putative endoribonuclease L-PSP  59.29 
 
 		 115 aa  131  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149481  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1775  endoribonuclease L-PSP  62.73 
 
 		 115 aa  131  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.634582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2737  putative ssRNA endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 115 aa  130  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3201  putative endoribonuclease L-PSP family protein  58.18 
 
 		 113 aa  130  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0954576  normal  0.771156 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1150  endoribonuclease L-PSP  56.25 
 
 		 114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.710558  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1242  hypothetical protein  56.25 
 
 		 114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3393  endoribonuclease L-PSP  58.26 
 
 		 116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.308192 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01773  endoribonuclease L-PSP family  53.51 
 
 		 115 aa  127  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1273  endoribonuclease L-PSP  53.1 
 
 		 120 aa  126  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6240  endoribonuclease L-PSP  58.26 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01561  translation initiation inhibitor  53.91 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3455  endoribonuclease L-PSP  53.04 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6409  endoribonuclease L-PSP  58.26 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6642  endoribonuclease L-PSP  58.26 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47970  Endoribonuclease L-PSP family protein  59.13 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2297  endoribonuclease L-PSP  56.36 
 
 		 113 aa  122  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4265  Endoribonuclease L-PSP  56.14 
 
 		 116 aa  121  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3771  Endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 		 117 aa  120  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2329  endoribonuclease L-PSP  52.63 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2379  endoribonuclease L-PSP  53.1 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4613  endoribonuclease L-PSP  51.75 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00014505  normal  0.903485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1357  endoribonuclease L-PSP  51.75 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2759  hypothetical protein  51.69 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1708  putative endoribonuclease L-PSP  50.88 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1397  endoribonuclease L-PSP  51.75 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0150121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2758  Endoribonuclease L-PSP  53.51 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0990  endoribonuclease L-PSP  51.75 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00403793  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1450  endoribonuclease L-PSP  51.75 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000258277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1472  endoribonuclease L-PSP  51.75 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.155856  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1543  hypothetical protein  50 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1099  hypothetical protein  50 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130213  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3823  Endoribonuclease L-PSP  54.46 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0959  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0541904  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2598  L-PSP family endoribonuclease  50 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0205  hypothetical protein  50 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197898  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4900  Endoribonuclease L-PSP  54.46 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6007  endoribonuclease L-PSP  55.75 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1989  Endoribonuclease L-PSP  52.17 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1560  endoribonuclease L-PSP  50.88 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01779  hypothetical protein  51.33 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.893197  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1834  Endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 		 115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00508894  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01767  hypothetical protein  51.33 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.712473  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2069  endoribonuclease L-PSP family protein  51.33 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1886  L-PSP family endoribonuclease  50 
 
 		 141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1897  endoribonuclease L-PSP family protein  51.33 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1732  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.125289  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1824  endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 		 115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.208797  normal  0.387771 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1379  endoribonuclease L-PSP family protein  51.33 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.618035  normal  0.177039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2536  endoribonuclease L-PSP family protein  51.33 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0868618  normal  0.902173 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2018  endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.711263  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2129  endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2036  endoribonuclease L-PSP family protein  51.33 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.818249  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1781  endoribonuclease L-PSP  50.88 
 
 		 140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2407  hypothetical protein  51.33 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000841178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4397  endoribonuclease L-PSP  49.15 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.455291 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0653  translation inhibitor of mRNA  46.43 
 
 		 116 aa  117  6e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>