More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01773 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01773  endoribonuclease L-PSP family  100 
 
 		 115 aa  235  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1150  endoribonuclease L-PSP  76.11 
 
 		 114 aa  181  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.710558  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1242  hypothetical protein  76.11 
 
 		 114 aa  181  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2929  Endoribonuclease L-PSP  76.99 
 
 		 115 aa  180  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2329  endoribonuclease L-PSP  65.18 
 
 		 127 aa  158  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2759  hypothetical protein  61.21 
 
 		 119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1099  hypothetical protein  60.71 
 
 		 117 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130213  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3771  Endoribonuclease L-PSP  60.71 
 
 		 117 aa  145  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0205  hypothetical protein  60.71 
 
 		 117 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197898  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0959  putative endoribonuclease L-PSP  60.71 
 
 		 117 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0541904  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1543  hypothetical protein  60.71 
 
 		 117 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4613  endoribonuclease L-PSP  61.61 
 
 		 117 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00014505  normal  0.903485 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1708  putative endoribonuclease L-PSP  60.71 
 
 		 117 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1886  L-PSP family endoribonuclease  59.82 
 
 		 141 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2598  L-PSP family endoribonuclease  59.82 
 
 		 117 aa  143  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1781  endoribonuclease L-PSP  61.61 
 
 		 140 aa  142  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1732  putative endoribonuclease L-PSP  59.82 
 
 		 117 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.125289  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1397  endoribonuclease L-PSP  60.71 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0150121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1450  endoribonuclease L-PSP  60.71 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000258277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0990  endoribonuclease L-PSP  60.71 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00403793  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1357  endoribonuclease L-PSP  60.71 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1472  endoribonuclease L-PSP  60.71 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.155856  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1369  hypothetical protein  58.04 
 
 		 133 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1560  endoribonuclease L-PSP  57.14 
 
 		 117 aa  133  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1273  endoribonuclease L-PSP  57.52 
 
 		 120 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2758  Endoribonuclease L-PSP  57.14 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0334  endoribonuclease L-PSP  54.46 
 
 		 114 aa  130  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4921  endoribonuclease L-PSP  56.14 
 
 		 115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4149  endoribonuclease L-PSP  51.79 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0653  translation inhibitor of mRNA  53.15 
 
 		 116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3954  Endoribonuclease L-PSP  51.79 
 
 		 117 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4948  Endoribonuclease L-PSP  53.51 
 
 		 115 aa  127  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4056  endoribonuclease L-PSP  51.79 
 
 		 120 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4502  Endoribonuclease L-PSP  53.91 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.654756 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3638  endoribonuclease L-PSP  50.89 
 
 		 118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3910  endoribonuclease L-PSP  54.46 
 
 		 116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4020  endoribonuclease L-PSP  53.91 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620706  normal  0.517505 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4031  endoribonuclease L-PSP  51.79 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4389  Endoribonuclease L-PSP  53.91 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.276873 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1158  endoribonuclease L-PSP  54.87 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0195416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3834  endoribonuclease L-PSP  50.89 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0102  endoribonuclease L-PSP family protein  53.98 
 
 		 117 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3652  endoribonuclease L-PSP  50.89 
 
 		 117 aa  125  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0236  endoribonuclease L-PSP  53.1 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0306  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0337  translation initiation inhibitor  50 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3393  endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 		 116 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.308192 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2672  hypothetical protein  53.1 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.35779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6240  endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0288  endoribonuclease L-PSP  50.44 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00205912  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6409  endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 		 131 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6642  endoribonuclease L-PSP  51.33 
 
 		 131 aa  123  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3317  hypothetical protein  50.91 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1019  hypothetical protein  53.57 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0961  hypothetical protein  53.57 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1365  endoribonuclease L-PSP  53.57 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.798025  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6077  hypothetical protein  52.21 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70010  hypothetical protein  52.21 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4474  endoribonuclease L-PSP  54.39 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0936  endoribonuclease L-PSP  56.64 
 
 		 118 aa  120  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0246  endoribonuclease L-PSP  52.21 
 
 		 116 aa  120  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1395  endoribonuclease L-PSP  50.45 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2737  putative ssRNA endoribonuclease L-PSP  50.45 
 
 		 115 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2376  endoribonuclease L-PSP  52.63 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337804  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2171  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  0.0971944 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1775  endoribonuclease L-PSP  51.35 
 
 		 115 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.634582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0413  endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 117 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0467  endoribonuclease L-PSP  50.89 
 
 		 117 aa  116  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0342744  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2026  endoribonuclease L-PSP  55.26 
 
 		 118 aa  115  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.232751  normal  0.248157 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4240  L-PSP family endoribonuclease  48.67 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.562901  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4265  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 116 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0725  Endoribonuclease L-PSP  46.43 
 
 		 116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799959  normal  0.37819 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1575  hypothetical protein  50.44 
 
 		 131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2936  hypothetical protein  48.21 
 
 		 113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3761  hypothetical protein  45.54 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0809  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2268  endoribonuclease L-PSP  48.21 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2886  Endoribonuclease L-PSP  48.21 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2626  Endoribonuclease L-PSP  48.21 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.658895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44200  hypothetical protein  45.54 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000922317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01561  translation initiation inhibitor  47.32 
 
 		 118 aa  110  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3201  putative endoribonuclease L-PSP family protein  48.67 
 
 		 113 aa  110  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0954576  normal  0.771156 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47970  Endoribonuclease L-PSP family protein  49.56 
 
 		 117 aa  110  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2297  endoribonuclease L-PSP  49.56 
 
 		 113 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4336  endoribonuclease L-PSP  47.79 
 
 		 123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.597458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0002  putative endoribonuclease L-PSP  46.02 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149481  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3455  endoribonuclease L-PSP  43.48 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0466  L-PSP family endoribonuclease  47.32 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0934  endoribonuclease L-PSP  46.02 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.989038  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0992  hypothetical protein  46.02 
 
 		 114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4503  endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 118 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5525  endoribonuclease L-PSP  50.96 
 
 		 106 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6007  endoribonuclease L-PSP  50.44 
 
 		 118 aa  107  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5466  endoribonuclease L-PSP  46.9 
 
 		 117 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4435  hypothetical protein  46.02 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1649  Endoribonuclease L-PSP  48.7 
 
 		 122 aa  105  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.123115 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2710  endoribonuclease L-PSP  49.11 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.813117 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6378  Endoribonuclease L-PSP  43.36 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0807375  normal  0.458934 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0063  endoribonuclease L-PSP  46.02 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.819868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4413  endoribonuclease L-PSP  46.09 
 
 		 122 aa  103  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333895  normal  0.375148 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>