More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1889 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1889  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 117 aa  234  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121968  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2710  endoribonuclease L-PSP  94.87 
 
 		 117 aa  223  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.813117 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6007  endoribonuclease L-PSP  86.96 
 
 		 118 aa  204  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7057  endoribonuclease L-PSP  82.05 
 
 		 117 aa  192  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945657  normal  0.394054 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4336  endoribonuclease L-PSP  53.04 
 
 		 123 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.597458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3393  endoribonuclease L-PSP  58.26 
 
 		 116 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.308192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4413  endoribonuclease L-PSP  53.91 
 
 		 122 aa  132  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333895  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6409  endoribonuclease L-PSP  58.26 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6642  endoribonuclease L-PSP  58.26 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6240  endoribonuclease L-PSP  58.26 
 
 		 116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2171  endoribonuclease L-PSP  53.91 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  0.0971944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0236  endoribonuclease L-PSP  55.36 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0102  endoribonuclease L-PSP family protein  53.57 
 
 		 117 aa  123  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01561  translation initiation inhibitor  52.21 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6077  hypothetical protein  52.68 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70010  hypothetical protein  52.68 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4372  endoribonuclease L-PSP  53.91 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3823  Endoribonuclease L-PSP  52.14 
 
 		 118 aa  120  7e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4900  Endoribonuclease L-PSP  52.14 
 
 		 118 aa  120  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2646  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.163859 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1775  endoribonuclease L-PSP  55.17 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.634582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1395  endoribonuclease L-PSP  54.31 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4474  endoribonuclease L-PSP  53.98 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2268  endoribonuclease L-PSP  53.04 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0467  endoribonuclease L-PSP  52.68 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0342744  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4240  L-PSP family endoribonuclease  51.79 
 
 		 115 aa  117  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.562901  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4435  hypothetical protein  46.43 
 
 		 117 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3317  hypothetical protein  48.21 
 
 		 117 aa  117  7e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4503  endoribonuclease L-PSP  50.44 
 
 		 118 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5466  endoribonuclease L-PSP  50.86 
 
 		 117 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0466  L-PSP family endoribonuclease  50.89 
 
 		 117 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2737  putative ssRNA endoribonuclease L-PSP  53.45 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3954  Endoribonuclease L-PSP  48.21 
 
 		 117 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4149  endoribonuclease L-PSP  48.21 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5822  hypothetical protein  53.64 
 
 		 116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0936  endoribonuclease L-PSP  54.39 
 
 		 118 aa  114  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0002  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 115 aa  114  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149481  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4948  Endoribonuclease L-PSP  54.39 
 
 		 115 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3201  putative endoribonuclease L-PSP family protein  52.68 
 
 		 113 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0954576  normal  0.771156 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4389  Endoribonuclease L-PSP  55.26 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.276873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4020  endoribonuclease L-PSP  55.26 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620706  normal  0.517505 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3638  endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0306  endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4056  endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3652  endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4265  Endoribonuclease L-PSP  51.79 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3834  endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4031  endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0334  endoribonuclease L-PSP  53.1 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0413  endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 117 aa  111  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67140  hypothetical protein  52.73 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0926922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4921  endoribonuclease L-PSP  54.46 
 
 		 115 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1242  hypothetical protein  51.82 
 
 		 114 aa  110  6e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1150  endoribonuclease L-PSP  51.82 
 
 		 114 aa  110  6e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.710558  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0337  translation initiation inhibitor  46.43 
 
 		 118 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0063  endoribonuclease L-PSP  49.14 
 
 		 117 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.819868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3910  endoribonuclease L-PSP  53.04 
 
 		 116 aa  110  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2622  endoribonuclease L-PSP  49.14 
 
 		 116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2376  endoribonuclease L-PSP  51.79 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337804  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4502  Endoribonuclease L-PSP  53.51 
 
 		 119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.654756 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2065  endoribonuclease L-PSP  47.83 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5525  endoribonuclease L-PSP  51.46 
 
 		 106 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4397  endoribonuclease L-PSP  44.92 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.455291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2329  endoribonuclease L-PSP  45.61 
 
 		 127 aa  107  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2672  hypothetical protein  50.86 
 
 		 116 aa  107  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.35779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2469  endoribonuclease L-PSP  45.54 
 
 		 121 aa  105  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301714  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1080  Endoribonuclease L-PSP  48.7 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3717  Endoribonuclease L-PSP  48.7 
 
 		 117 aa  104  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.306574 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2598  L-PSP family endoribonuclease  47.32 
 
 		 117 aa  104  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4426  endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 		 122 aa  104  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0537399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3771  Endoribonuclease L-PSP  45.22 
 
 		 117 aa  103  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1708  putative endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 117 aa  103  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1732  putative endoribonuclease L-PSP  46.43 
 
 		 117 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.125289  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1886  L-PSP family endoribonuclease  46.43 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01773  endoribonuclease L-PSP family  47.32 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4613  endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00014505  normal  0.903485 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2495  hypothetical protein  47.83 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1781  endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316896  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1099  hypothetical protein  45.54 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130213  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47970  Endoribonuclease L-PSP family protein  45.54 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0959  putative endoribonuclease L-PSP  45.54 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0541904  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1543  hypothetical protein  45.54 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0205  hypothetical protein  45.54 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197898  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1357  endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2759  hypothetical protein  45.69 
 
 		 119 aa  100  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0246  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1273  endoribonuclease L-PSP  45.22 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2297  endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 113 aa  100  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1450  endoribonuclease L-PSP  46.43 
 
 		 117 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000258277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6378  Endoribonuclease L-PSP  45.54 
 
 		 114 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0807375  normal  0.458934 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0990  endoribonuclease L-PSP  46.43 
 
 		 117 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00403793  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1397  endoribonuclease L-PSP  46.43 
 
 		 117 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0150121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1472  endoribonuclease L-PSP  46.43 
 
 		 117 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.155856  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1369  hypothetical protein  44.64 
 
 		 133 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0288  endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 116 aa  99.4  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00205912  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2758  Endoribonuclease L-PSP  45.54 
 
 		 117 aa  99.4  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0575  endoribonuclease L-PSP  46.02 
 
 		 125 aa  99.8  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0725  Endoribonuclease L-PSP  41.74 
 
 		 116 aa  98.6  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799959  normal  0.37819 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1560  endoribonuclease L-PSP  44.64 
 
 		 117 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2400  endoribonuclease L-PSP  41.44 
 
 		 116 aa  95.5  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.690402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>