More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2495 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2495  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  239  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2469  endoribonuclease L-PSP  55.36 
 
 		 121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301714  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3910  endoribonuclease L-PSP  53.85 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4413  endoribonuclease L-PSP  49.57 
 
 		 122 aa  124  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333895  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4336  endoribonuclease L-PSP  48.28 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.597458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4474  endoribonuclease L-PSP  50.44 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7057  endoribonuclease L-PSP  52.17 
 
 		 117 aa  117  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945657  normal  0.394054 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1174  endoribonuclease L-PSP  50.44 
 
 		 114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2065  endoribonuclease L-PSP  48.7 
 
 		 116 aa  110  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0809  endoribonuclease L-PSP  48.21 
 
 		 115 aa  110  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4265  Endoribonuclease L-PSP  49.12 
 
 		 116 aa  110  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0961  hypothetical protein  48.25 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0992  hypothetical protein  46.43 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1019  hypothetical protein  48.25 
 
 		 114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0934  endoribonuclease L-PSP  46.43 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.989038  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2737  putative ssRNA endoribonuclease L-PSP  48.25 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1395  endoribonuclease L-PSP  48.25 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0306  endoribonuclease L-PSP  43.36 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0467  endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0342744  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1781  endoribonuclease L-PSP  48.21 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4948  Endoribonuclease L-PSP  46.49 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1365  endoribonuclease L-PSP  48.25 
 
 		 114 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.798025  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6007  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1357  endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3393  endoribonuclease L-PSP  48.28 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.308192 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3834  endoribonuclease L-PSP  43.36 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1397  endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0150121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2622  endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4921  endoribonuclease L-PSP  46.9 
 
 		 115 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0990  endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00403793  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1450  endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000258277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1472  endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.155856  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4149  endoribonuclease L-PSP  44.64 
 
 		 120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2400  endoribonuclease L-PSP  46.96 
 
 		 116 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.690402  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0337  translation initiation inhibitor  42.48 
 
 		 118 aa  107  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3954  Endoribonuclease L-PSP  44.64 
 
 		 117 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0466  L-PSP family endoribonuclease  46.43 
 
 		 117 aa  107  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4900  Endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 118 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0334  endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 114 aa  107  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3652  endoribonuclease L-PSP  43.36 
 
 		 117 aa  107  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3823  Endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 118 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3638  endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 118 aa  107  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1775  endoribonuclease L-PSP  48.28 
 
 		 115 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.634582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0002  putative endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 115 aa  106  9.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149481  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5466  endoribonuclease L-PSP  46.9 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1369  hypothetical protein  45.54 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3317  hypothetical protein  44.25 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4503  endoribonuclease L-PSP  45.13 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2598  L-PSP family endoribonuclease  46.43 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1708  putative endoribonuclease L-PSP  46.43 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4613  endoribonuclease L-PSP  46.43 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00014505  normal  0.903485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0936  endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2710  endoribonuclease L-PSP  47.83 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.813117 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6409  endoribonuclease L-PSP  46.55 
 
 		 131 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4056  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 120 aa  104  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6642  endoribonuclease L-PSP  46.55 
 
 		 131 aa  104  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1560  endoribonuclease L-PSP  44.64 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2171  endoribonuclease L-PSP  45.22 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  0.0971944 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0959  putative endoribonuclease L-PSP  45.54 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0541904  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0205  hypothetical protein  45.54 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197898  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1099  hypothetical protein  45.54 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130213  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1732  putative endoribonuclease L-PSP  45.54 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.125289  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6240  endoribonuclease L-PSP  46.55 
 
 		 116 aa  104  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1886  L-PSP family endoribonuclease  45.54 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1543  hypothetical protein  45.54 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4031  endoribonuclease L-PSP  41.96 
 
 		 117 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47970  Endoribonuclease L-PSP family protein  48.67 
 
 		 117 aa  103  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2762  endoribonuclease L-PSP  45.61 
 
 		 121 aa  103  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6378  Endoribonuclease L-PSP  44.64 
 
 		 114 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0807375  normal  0.458934 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3771  Endoribonuclease L-PSP  43.48 
 
 		 117 aa  102  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0102  endoribonuclease L-PSP family protein  47.66 
 
 		 117 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1273  endoribonuclease L-PSP  45.22 
 
 		 120 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01561  translation initiation inhibitor  45.13 
 
 		 118 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0246  endoribonuclease L-PSP  43.36 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0236  endoribonuclease L-PSP  48.6 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2758  Endoribonuclease L-PSP  44.64 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1889  Endoribonuclease L-PSP  47.83 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121968  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2268  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6077  hypothetical protein  46.9 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70010  hypothetical protein  46.9 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2026  endoribonuclease L-PSP  47.37 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.232751  normal  0.248157 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0288  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 116 aa  101  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00205912  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5822  hypothetical protein  49.55 
 
 		 116 aa  101  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1932  Endoribonuclease L-PSP  46.43 
 
 		 114 aa  100  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44200  hypothetical protein  44.64 
 
 		 117 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000922317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3717  Endoribonuclease L-PSP  45.13 
 
 		 117 aa  100  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.306574 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4372  endoribonuclease L-PSP  43.97 
 
 		 117 aa  100  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3761  hypothetical protein  43.75 
 
 		 117 aa  100  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0653  translation inhibitor of mRNA  44.83 
 
 		 116 aa  100  8e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4435  hypothetical protein  41.59 
 
 		 117 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000040  endoribonuclease L-PSP family protein  40.87 
 
 		 117 aa  99.8  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2376  endoribonuclease L-PSP  47.83 
 
 		 114 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337804  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0413  endoribonuclease L-PSP  40.18 
 
 		 117 aa  99.4  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67140  hypothetical protein  48.65 
 
 		 116 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0926922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2297  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 113 aa  98.6  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4397  endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 120 aa  97.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.455291 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3201  putative endoribonuclease L-PSP family protein  43.75 
 
 		 113 aa  97.8  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0954576  normal  0.771156 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1834  Endoribonuclease L-PSP  44.83 
 
 		 115 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00508894  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1824  endoribonuclease L-PSP  44.83 
 
 		 115 aa  97.8  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.208797  normal  0.387771 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2379  endoribonuclease L-PSP  43.36 
 
 		 114 aa  97.8  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>