268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4413 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4413  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 122 aa  247  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.333895  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4336  endoribonuclease L-PSP  81.51 
 
 		 123 aa  207  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.597458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7057  endoribonuclease L-PSP  55.56 
 
 		 117 aa  140  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945657  normal  0.394054 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2710  endoribonuclease L-PSP  53.85 
 
 		 117 aa  135  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.813117 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1889  Endoribonuclease L-PSP  53.91 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121968  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6007  endoribonuclease L-PSP  53.45 
 
 		 118 aa  131  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2495  hypothetical protein  49.57 
 
 		 116 aa  124  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4372  endoribonuclease L-PSP  51.72 
 
 		 117 aa  121  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1099  hypothetical protein  48.67 
 
 		 117 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130213  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2598  L-PSP family endoribonuclease  49.56 
 
 		 117 aa  120  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2329  endoribonuclease L-PSP  53.04 
 
 		 127 aa  120  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1543  hypothetical protein  48.67 
 
 		 117 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0205  hypothetical protein  48.67 
 
 		 117 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197898  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0959  putative endoribonuclease L-PSP  48.67 
 
 		 117 aa  120  5e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0541904  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1886  L-PSP family endoribonuclease  48.67 
 
 		 141 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1732  putative endoribonuclease L-PSP  48.67 
 
 		 117 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.125289  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1450  endoribonuclease L-PSP  49.56 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000258277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0246  endoribonuclease L-PSP  46.9 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0990  endoribonuclease L-PSP  49.56 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00403793  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1472  endoribonuclease L-PSP  49.56 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.155856  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1708  putative endoribonuclease L-PSP  47.79 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1397  endoribonuclease L-PSP  49.56 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0150121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1781  endoribonuclease L-PSP  48.67 
 
 		 140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1357  endoribonuclease L-PSP  48.67 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5822  hypothetical protein  50.88 
 
 		 116 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3910  endoribonuclease L-PSP  49.14 
 
 		 116 aa  116  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6077  hypothetical protein  47.79 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3771  Endoribonuclease L-PSP  48.28 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1369  hypothetical protein  48.67 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2469  endoribonuclease L-PSP  52.21 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70010  hypothetical protein  47.79 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67140  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  114  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0926922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4613  endoribonuclease L-PSP  47.79 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00014505  normal  0.903485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4435  hypothetical protein  44.25 
 
 		 117 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2758  Endoribonuclease L-PSP  48.67 
 
 		 117 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1560  endoribonuclease L-PSP  46.9 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0102  endoribonuclease L-PSP family protein  46.02 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0236  endoribonuclease L-PSP  45.13 
 
 		 117 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7400  hypothetical protein  46.9 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47970  Endoribonuclease L-PSP family protein  49.56 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4474  endoribonuclease L-PSP  47.01 
 
 		 117 aa  108  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1158  endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0195416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6409  endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6642  endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0334  endoribonuclease L-PSP  44.74 
 
 		 114 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6240  endoribonuclease L-PSP  46.15 
 
 		 116 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01773  endoribonuclease L-PSP family  46.09 
 
 		 115 aa  103  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3393  endoribonuclease L-PSP  45.3 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.308192 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1242  hypothetical protein  46.02 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4265  Endoribonuclease L-PSP  46.02 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1150  endoribonuclease L-PSP  46.02 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.710558  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2737  putative ssRNA endoribonuclease L-PSP  45.22 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1395  endoribonuclease L-PSP  45.22 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1273  endoribonuclease L-PSP  42.24 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5525  endoribonuclease L-PSP  45.63 
 
 		 106 aa  101  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2376  endoribonuclease L-PSP  46.96 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337804  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2171  endoribonuclease L-PSP  44.83 
 
 		 117 aa  100  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  0.0971944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4921  endoribonuclease L-PSP  46.96 
 
 		 115 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1775  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 115 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.634582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3834  endoribonuclease L-PSP  40.17 
 
 		 118 aa  97.8  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2759  hypothetical protein  47.01 
 
 		 119 aa  97.4  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2622  endoribonuclease L-PSP  43.97 
 
 		 116 aa  97.1  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0337  translation initiation inhibitor  39.32 
 
 		 118 aa  97.1  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2929  Endoribonuclease L-PSP  45.71 
 
 		 115 aa  97.1  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2400  endoribonuclease L-PSP  40.54 
 
 		 116 aa  97.1  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.690402  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0306  endoribonuclease L-PSP  40.17 
 
 		 118 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0936  endoribonuclease L-PSP  41.74 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0467  endoribonuclease L-PSP  44.25 
 
 		 117 aa  96.7  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0342744  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1019  hypothetical protein  42.48 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01561  translation initiation inhibitor  41.23 
 
 		 118 aa  95.9  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3638  endoribonuclease L-PSP  40.17 
 
 		 118 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0961  hypothetical protein  42.48 
 
 		 114 aa  96.3  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3954  Endoribonuclease L-PSP  41.59 
 
 		 117 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4900  Endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1019  endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.669958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2268  endoribonuclease L-PSP  42.24 
 
 		 117 aa  95.9  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3823  Endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 118 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4149  endoribonuclease L-PSP  41.59 
 
 		 120 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1575  hypothetical protein  42.24 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0475  endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2646  endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.163859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3761  hypothetical protein  41.59 
 
 		 117 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1345  endoribonuclease  41.59 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0475282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5466  endoribonuclease L-PSP  43.1 
 
 		 117 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06343  hypothetical protein  40.52 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2065  endoribonuclease L-PSP  42.37 
 
 		 116 aa  93.2  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0413  endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3652  endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 117 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3317  hypothetical protein  38.94 
 
 		 117 aa  92.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4056  endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 120 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4948  Endoribonuclease L-PSP  42.24 
 
 		 115 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1365  endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 114 aa  91.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.798025  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4031  endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8317  Endoribonuclease L-PSP  42.61 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.535132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44200  hypothetical protein  40.71 
 
 		 117 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000922317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6255  Endoribonuclease L-PSP  41.59 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3201  putative endoribonuclease L-PSP family protein  39.82 
 
 		 113 aa  90.1  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0954576  normal  0.771156 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4503  endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 118 aa  89.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0063  endoribonuclease L-PSP  42.24 
 
 		 117 aa  89.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.819868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0809  endoribonuclease L-PSP  43.36 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>