More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0002 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0002  putative endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 115 aa  239  7.999999999999999e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149481  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01561  translation initiation inhibitor  84.96 
 
 		 118 aa  200  5e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0466  L-PSP family endoribonuclease  83.33 
 
 		 117 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4240  L-PSP family endoribonuclease  82.46 
 
 		 115 aa  195  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.562901  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4503  endoribonuclease L-PSP  80.7 
 
 		 118 aa  194  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2646  endoribonuclease L-PSP  81.9 
 
 		 116 aa  194  4.0000000000000005e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.163859 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0467  endoribonuclease L-PSP  82.46 
 
 		 117 aa  193  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0342744  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2268  endoribonuclease L-PSP  76.32 
 
 		 117 aa  185  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2171  endoribonuclease L-PSP  71.05 
 
 		 117 aa  174  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.91859  normal  0.0971944 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3317  hypothetical protein  67.54 
 
 		 117 aa  160  7e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0306  endoribonuclease L-PSP  65.18 
 
 		 118 aa  157  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3652  endoribonuclease L-PSP  65.18 
 
 		 117 aa  157  6e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3834  endoribonuclease L-PSP  65.18 
 
 		 118 aa  157  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0337  translation initiation inhibitor  64.29 
 
 		 118 aa  155  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3638  endoribonuclease L-PSP  64.29 
 
 		 118 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4056  endoribonuclease L-PSP  65.18 
 
 		 120 aa  154  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4031  endoribonuclease L-PSP  64.29 
 
 		 117 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0288  endoribonuclease L-PSP  63.72 
 
 		 116 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00205912  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4149  endoribonuclease L-PSP  62.5 
 
 		 120 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3954  Endoribonuclease L-PSP  62.5 
 
 		 117 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0413  endoribonuclease L-PSP  58.93 
 
 		 117 aa  142  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.343212  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2297  endoribonuclease L-PSP  61.95 
 
 		 113 aa  136  8.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.718844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2762  endoribonuclease L-PSP  56.41 
 
 		 121 aa  133  8e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0236  endoribonuclease L-PSP  53.98 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4948  Endoribonuclease L-PSP  59.29 
 
 		 115 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0102  endoribonuclease L-PSP family protein  53.1 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2065  endoribonuclease L-PSP  56.64 
 
 		 116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.383791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3201  putative endoribonuclease L-PSP family protein  57.52 
 
 		 113 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0954576  normal  0.771156 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4397  endoribonuclease L-PSP  53.91 
 
 		 120 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.455291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6077  hypothetical protein  53.1 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70010  hypothetical protein  53.1 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5525  endoribonuclease L-PSP  55.77 
 
 		 106 aa  124  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000040  endoribonuclease L-PSP family protein  50 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4921  endoribonuclease L-PSP  54.46 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47970  Endoribonuclease L-PSP family protein  53.98 
 
 		 117 aa  120  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4613  endoribonuclease L-PSP  50.89 
 
 		 117 aa  119  9e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00014505  normal  0.903485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1357  endoribonuclease L-PSP  50.89 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.430779  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1397  endoribonuclease L-PSP  50.89 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0150121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1450  endoribonuclease L-PSP  50.89 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000258277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0475  endoribonuclease L-PSP  51.79 
 
 		 112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1781  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1886  L-PSP family endoribonuclease  49.12 
 
 		 141 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0683608  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1732  putative endoribonuclease L-PSP  49.12 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.125289  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0990  endoribonuclease L-PSP  50.89 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00403793  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1472  endoribonuclease L-PSP  50.89 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.155856  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6007  endoribonuclease L-PSP  50.43 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1099  hypothetical protein  49.12 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130213  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1543  hypothetical protein  49.12 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4265  Endoribonuclease L-PSP  50.89 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0205  hypothetical protein  49.12 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0197898  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0959  putative endoribonuclease L-PSP  49.12 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0541904  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1369  hypothetical protein  49.11 
 
 		 133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2758  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1708  putative endoribonuclease L-PSP  48.25 
 
 		 117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1019  endoribonuclease L-PSP  49.56 
 
 		 112 aa  117  6e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.669958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2598  L-PSP family endoribonuclease  48.67 
 
 		 117 aa  117  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1345  endoribonuclease  48.67 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0475282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4474  endoribonuclease L-PSP  47.79 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2710  endoribonuclease L-PSP  50.89 
 
 		 117 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.813117 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4435  hypothetical protein  49.56 
 
 		 117 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622606 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1560  endoribonuclease L-PSP  47.32 
 
 		 117 aa  114  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1889  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 117 aa  114  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121968  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0334  endoribonuclease L-PSP  50.89 
 
 		 114 aa  113  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0246  endoribonuclease L-PSP  49.56 
 
 		 116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0809  endoribonuclease L-PSP  50.44 
 
 		 115 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3910  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3455  endoribonuclease L-PSP  46.9 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4389  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.276873 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4426  endoribonuclease L-PSP  47.01 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0537399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4020  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620706  normal  0.517505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4502  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 119 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.654756 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1150  endoribonuclease L-PSP  47.79 
 
 		 114 aa  110  9e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.710558  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1242  hypothetical protein  47.79 
 
 		 114 aa  110  9e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1775  endoribonuclease L-PSP  50.45 
 
 		 115 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.634582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01773  endoribonuclease L-PSP family  46.02 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3393  endoribonuclease L-PSP  45.54 
 
 		 116 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.308192 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4900  Endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1174  endoribonuclease L-PSP  48.21 
 
 		 114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3823  Endoribonuclease L-PSP  42.98 
 
 		 118 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7057  endoribonuclease L-PSP  49.11 
 
 		 117 aa  107  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945657  normal  0.394054 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0936  endoribonuclease L-PSP  49.56 
 
 		 118 aa  107  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.453794 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3771  Endoribonuclease L-PSP  47.79 
 
 		 117 aa  107  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2495  hypothetical protein  47.32 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6409  endoribonuclease L-PSP  44.64 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6240  endoribonuclease L-PSP  44.64 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6642  endoribonuclease L-PSP  44.64 
 
 		 131 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0992  hypothetical protein  43.36 
 
 		 114 aa  104  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0934  endoribonuclease L-PSP  43.36 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.989038  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2672  hypothetical protein  46.96 
 
 		 116 aa  104  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.35779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1395  endoribonuclease L-PSP  47.75 
 
 		 115 aa  103  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6255  Endoribonuclease L-PSP  46.49 
 
 		 118 aa  103  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0968963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2329  endoribonuclease L-PSP  45.54 
 
 		 127 aa  103  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0063  endoribonuclease L-PSP  45.05 
 
 		 117 aa  103  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.819868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5466  endoribonuclease L-PSP  43.24 
 
 		 117 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0575  endoribonuclease L-PSP  42.48 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5822  hypothetical protein  48.65 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67140  hypothetical protein  48.65 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0926922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2737  putative ssRNA endoribonuclease L-PSP  47.75 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3717  Endoribonuclease L-PSP  45.05 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.306574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2376  endoribonuclease L-PSP  45.54 
 
 		 114 aa  100  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337804  normal  0.72291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>