139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2630 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2630  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 171 aa  338  2.9999999999999998e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02286  TdcF  51.56 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1381  endoribonuclease L-PSP  52.71 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.63415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0702  Endoribonuclease L-PSP  47.66 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0810  endoribonuclease L-PSP  42 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0861  endoribonuclease L-PSP  47.29 
 
 		 164 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1722  endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 170 aa  89.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3006  deaminase AmnE, putative  37.98 
 
 		 144 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0930395  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2887  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 144 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00911045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  37.5 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07405  Endoribonuclease L-PSP  37.78 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0084  Endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5501  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1148  2-aminomuconate deaminase  34.78 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0067  Endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 244 aa  53.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3898  endoribonuclease L-PSP  31.37 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.216978 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  38.89 
 
 		 128 aa  51.2  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7642  endoribonuclease L-PSP  34.04 
 
 		 143 aa  51.2  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.882993 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 150 aa  51.2  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5138  endoribonuclease L-PSP  35.56 
 
 		 140 aa  50.8  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0310879 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  32.58 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5211  2-aminomuconate deaminase  35.56 
 
 		 145 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236738  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 126 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 124 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1470  Endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9111  endoribonuclease L-PSP  27.66 
 
 		 140 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  34 
 
 		 126 aa  48.9  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 141 aa  48.1  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3522  endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 143 aa  48.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.270203 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0127  translation initiation inhibitor (endoribonuclease L-PSP)  35.45 
 
 		 129 aa  48.1  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  39 
 
 		 129 aa  47.8  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  40.66 
 
 		 128 aa  47.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0684  endoribonuclease L-PSP  32.22 
 
 		 138 aa  47.8  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 128 aa  47.8  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3200  Endoribonuclease L-PSP  29.36 
 
 		 215 aa  47.4  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172022  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 		 126 aa  47.4  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 130 aa  47.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  35.29 
 
 		 130 aa  47.4  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 126 aa  47  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 130 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  39.29 
 
 		 129 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0475  endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  37.5 
 
 		 126 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 124 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3120  endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 124 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4079  putative endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 127 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1409  endoribonuclease L-PSP  32.22 
 
 		 142 aa  46.6  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 125 aa  45.8  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1672  Endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 130 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4031  endoribonuclease L-PSP  29.37 
 
 		 117 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  33.33 
 
 		 125 aa  44.7  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 131 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1223  endoribonuclease L-PSP  36.97 
 
 		 134 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.901063 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3051  endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 132 aa  44.7  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 124 aa  44.7  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  28.7 
 
 		 140 aa  44.7  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6623  Endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 129 aa  44.7  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808088  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0246  endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 116 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1385  endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 132 aa  44.3  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 124 aa  44.3  0.0009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  35.09 
 
 		 133 aa  44.3  0.001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  34.69 
 
 		 126 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2982  Endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 123 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 126 aa  43.9  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 131 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2929  Endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 115 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5680  Endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 129 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.979461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  35.71 
 
 		 120 aa  43.9  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  30.58 
 
 		 131 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 131 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  34.56 
 
 		 138 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  33.81 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 131 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  35.4 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  28.17 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4056  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 120 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3954  Endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 117 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  32.37 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  34.02 
 
 		 123 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4149  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 120 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2329  endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 127 aa  43.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3558  hypothetical protein  28.8 
 
 		 129 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  31.88 
 
 		 127 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  35.4 
 
 		 120 aa  42.4  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1030  Endoribonuclease L-PSP  27.68 
 
 		 135 aa  42.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.703887 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  35.4 
 
 		 120 aa  42.4  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  25.9 
 
 		 133 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1831  putative 2-aminomuconate deaminase  30.77 
 
 		 132 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.502241 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 126 aa  42  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 126 aa  42  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1708  putative endoribonuclease L-PSP  30.7 
 
 		 117 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>