83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0810 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0810  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 166 aa  330  4e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02286  TdcF  65.31 
 
 		 155 aa  192  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0702  Endoribonuclease L-PSP  53.38 
 
 		 168 aa  172  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0861  endoribonuclease L-PSP  54.6 
 
 		 164 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1722  endoribonuclease L-PSP  46.11 
 
 		 170 aa  148  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1381  endoribonuclease L-PSP  46.53 
 
 		 165 aa  124  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.63415  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3006  deaminase AmnE, putative  40.56 
 
 		 144 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0930395  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2887  endoribonuclease L-PSP  40.28 
 
 		 144 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00911045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2630  endoribonuclease L-PSP  44.63 
 
 		 171 aa  107  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0084  Endoribonuclease L-PSP  33.72 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0067  Endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3200  Endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 215 aa  64.3  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172022  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  33.68 
 
 		 142 aa  51.2  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1464  endoribonuclease L-PSP  36.08 
 
 		 93 aa  50.8  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.643404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  31.97 
 
 		 134 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3740  endoribonuclease L-PSP  26.43 
 
 		 127 aa  48.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5138  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 140 aa  47.8  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0310879 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  33.58 
 
 		 126 aa  47.4  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1816  endoribonuclease L-PSP  31 
 
 		 129 aa  47  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  29.93 
 
 		 140 aa  47  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0887  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 421 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.236769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44200  hypothetical protein  35.48 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000922317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0416  endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0920711 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0127  translation initiation inhibitor (endoribonuclease L-PSP)  36.96 
 
 		 129 aa  45.4  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  29.63 
 
 		 124 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3761  hypothetical protein  34.41 
 
 		 117 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  31.73 
 
 		 132 aa  44.7  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1409  endoribonuclease L-PSP  26.37 
 
 		 142 aa  44.3  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 126 aa  44.3  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 128 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4426  hypothetical protein  30.88 
 
 		 129 aa  43.9  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0305727 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 128 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02931  hypothetical protein  30.88 
 
 		 129 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4711  putative endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 128 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.31675 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4861  putative endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 128 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4805  putative endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 128 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3244  hypothetical protein  30.88 
 
 		 129 aa  43.9  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.536174  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3409  hypothetical protein  30.88 
 
 		 129 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0590  endoribonuclease L-PSP  30.88 
 
 		 129 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0585  hypothetical protein  30.88 
 
 		 129 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02980  predicted L-PSP (mRNA) endoribonuclease  30.88 
 
 		 129 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03190  lipoprotein  30 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  29.79 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3301  hypothetical protein  30.88 
 
 		 129 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3587  hypothetical protein  31.9 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  29.82 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  26.09 
 
 		 127 aa  43.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  40.24 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  30.48 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  24.22 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  36.04 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3858  endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.91936 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 124 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  29.2 
 
 		 129 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 129 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  23.88 
 
 		 131 aa  42.4  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5211  2-aminomuconate deaminase  28.57 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.236738  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 129 aa  42.4  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  30.63 
 
 		 129 aa  42.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  30.48 
 
 		 130 aa  42  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  32.38 
 
 		 130 aa  42  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3266  endoribonuclease L-PSP  29.79 
 
 		 128 aa  42  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  30.88 
 
 		 126 aa  42  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  25.51 
 
 		 128 aa  42  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1955  endoribonuclease L-PSP  29.81 
 
 		 130 aa  41.6  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 		 128 aa  41.6  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6185  endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 149 aa  41.6  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.89906  normal  0.555721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  31.63 
 
 		 128 aa  41.6  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07405  Endoribonuclease L-PSP  29.35 
 
 		 141 aa  41.2  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  29.85 
 
 		 125 aa  41.2  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  34.83 
 
 		 125 aa  41.2  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  25.18 
 
 		 140 aa  40.8  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3858  L-PSP family endoribonuclease  26.88 
 
 		 125 aa  40.8  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.956298  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0365  endoribonuclease L-PSP  30.51 
 
 		 128 aa  40.8  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0691  Endoribonuclease L-PSP  27.47 
 
 		 116 aa  40.8  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  30.51 
 
 		 128 aa  40.8  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2009  endoribonuclease L-PSP  28.09 
 
 		 143 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.673939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  30.51 
 
 		 128 aa  40.8  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  40.4  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>