More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2372 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 127 aa  259  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  75.59 
 
 		 127 aa  214  5e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  46.09 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  44.8 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  38.1 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  42.52 
 
 		 132 aa  106  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 132 aa  105  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  42.06 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 118 aa  97.4  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 133 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  39.34 
 
 		 132 aa  96.3  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  39.02 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  42.11 
 
 		 130 aa  94.4  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  41.12 
 
 		 205 aa  94.4  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  38.71 
 
 		 204 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 204 aa  93.6  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 204 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 204 aa  93.6  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  38.71 
 
 		 135 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 135 aa  93.6  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 135 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 135 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  37.6 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 138 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  41.67 
 
 		 480 aa  87.8  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 127 aa  84  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 121 aa  84  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  34.95 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0935  Endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  32.03 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  28.85 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  31.45 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  28 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3905  Endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0995322 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  29.03 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  31.45 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  30.09 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5133  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81404  normal  0.0532843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  28.7 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 394 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  29.27 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  30.63 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  31.45 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  28.97 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  26.61 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  26.21 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  28.18 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  28.97 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  29 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03190  lipoprotein  27.36 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  30.28 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  28.91 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0674  endoribonuclease L-PSP  25.2 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.892091 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0810  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  29.36 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  28.97 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  29.36 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  28.44 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  27.27 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4362  endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  29.36 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5043  endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.637864  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5817  endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3937  pyrimidine utilization protein C  30.77 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.166806  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  25.69 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00762  endoribonuclease L-PSP family protein  35 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2156  Endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  29.36 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>