More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3938 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 133 aa  271  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  54.76 
 
 		 394 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  55.12 
 
 		 402 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  52.31 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  40.8 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  36.64 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 140 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 140 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 140 aa  91.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 		 131 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 136 aa  90.1  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 		 131 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  35.61 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  36.64 
 
 		 131 aa  87  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  43.18 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  42.62 
 
 		 125 aa  76.6  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  41.46 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4261  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  34.62 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  40.65 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  39.53 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  37.68 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  40.32 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  36.64 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  34.15 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  31.36 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  37.4 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  38.17 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4890  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  34.71 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  34.71 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  31.67 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  32.52 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  33.88 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3558  hypothetical protein  34.11 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  30.23 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  31.06 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  34.96 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0668  endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4710  endoribonuclease L-PSP  30.19 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0704377  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2416  putative endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.769165 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1672  Endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 130 aa  62  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00181671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  33.59 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  33.06 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>