More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1821 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 132 aa  270  7e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  48.39 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 128 aa  124  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  51.67 
 
 		 133 aa  121  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 132 aa  116  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  51.67 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  48.72 
 
 		 130 aa  113  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  43.2 
 
 		 127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 127 aa  105  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  41.8 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  47.5 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  46.22 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  45.83 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  45.83 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 		 129 aa  97.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  44.17 
 
 		 142 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  48.6 
 
 		 205 aa  97.4  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  44.96 
 
 		 133 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 127 aa  94  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 127 aa  90.5  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  37.4 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  40.87 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  39.84 
 
 		 121 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 126 aa  84.3  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 131 aa  83.6  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  37.3 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  37.29 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 394 aa  81.3  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  37.17 
 
 		 402 aa  79.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  41.53 
 
 		 480 aa  79.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  36.29 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0935  Endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  32.08 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  35.25 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  35.25 
 
 		 204 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 204 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 204 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 204 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4748  endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0742897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  39.17 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 140 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  36.89 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  34.82 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  31.13 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04783  hypothetical protein  37.14 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05655  hypothetical protein  37.14 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  33.68 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  28.18 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6043  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143152  hitchhiker  0.000408683 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  30.28 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4710  endoribonuclease L-PSP  36.73 
 
 		 125 aa  67.4  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0704377  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  32.2 
 
 		 129 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  29.37 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  29.37 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  32.43 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  27.78 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03180  conserved hypothetical protein  33.8 
 
 		 500 aa  66.2  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.305497  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  33.33 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  33.01 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6837  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0440077  normal  0.0291041 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  30.28 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>