More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0915 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 140 aa  285  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  90 
 
 		 140 aa  259  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  90 
 
 		 140 aa  259  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  90 
 
 		 140 aa  259  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  87.31 
 
 		 136 aa  241  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  87.31 
 
 		 136 aa  240  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  37.69 
 
 		 131 aa  98.2  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  40.8 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  37.5 
 
 		 402 aa  88.2  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  36.59 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  38.06 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 394 aa  84.7  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  33.33 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2269  Endoribonuclease L-PSP  35.2 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  32.52 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  34.68 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  38.05 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  37.8 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  35.83 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0720  endoribonuclease L-PSP  39.6 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0181894  hitchhiker  0.000000890707 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0566  endoribonuclease L-PSP, putative  39.6 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  41.41 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  36.03 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  33 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  33.85 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  36.03 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  27.78 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  36.03 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2982  Endoribonuclease L-PSP  39.32 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  39.2 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  33 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  31.97 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3236  YjgF-like protein  34.86 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2009  endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.673939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 130 aa  67  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4974  putative endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 		 129 aa  66.6  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3880  putative endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.196354  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  34.31 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0333  putative endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3980  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2150  YjgF-like protein  32.74 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1821  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623023  normal  0.012204 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1148  2-aminomuconate deaminase  34.53 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.135879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2066  Endoribonuclease L-PSP  38.38 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.582697  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  32.11 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3500  putative endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  32.32 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  36.67 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  35.48 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  32.8 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  37.82 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5138  endoribonuclease L-PSP  34.52 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0310879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1554  putative endoribonuclease L-PSP  39.17 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  35.92 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>