More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4350 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 133 aa  267  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  51.52 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  44.96 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  42.64 
 
 		 185 aa  97.1  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  45.6 
 
 		 161 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  45.74 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2176  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589076  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0647  endoribonuclease L-PSP  37.3 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  40.62 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  40.62 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  38.35 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  38.35 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  38.35 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  47.9 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4539  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293828  normal  0.437318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  42.96 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  38.52 
 
 		 135 aa  78.2  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  34.59 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  39.71 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  35.04 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  33.08 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  33.83 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1188  endoribonuclease L-PSP  38.73 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1266  hypothetical protein  37.4 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.4759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3363  endoribonuclease L-PSP  36.3 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188913  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  37.5 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  39.37 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  32.33 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2275  endoribonuclease L-PSP  41.98 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.321934  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  38.52 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  31.06 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  37.78 
 
 		 146 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2405  endoribonuclease L-PSP  40.16 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.996899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  38.84 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  31.34 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0382  endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395966  normal  0.101256 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  34.56 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  40.34 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1441  Endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  37.88 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  36.76 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  36.64 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0780  Endoribonuclease L-PSP  41.53 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  37.17 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  37.78 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  37.17 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  39.42 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  37.78 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  37.78 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3519  endoribonuclease L-PSP  40.17 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  34.23 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1711  endoribonuclease L-PSP  36.75 
 
 		 135 aa  60.1  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0370  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 136 aa  60.1  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5271  endoribonuclease L-PSP  37.93 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  31.39 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2016  endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0910058  normal  0.042718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4836  endoribonuclease L-PSP family protein  33.33 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1787  endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5769  endoribonuclease L-PSP family protein  33.33 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.81717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  29.32 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  30.88 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  39.62 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5718  Endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.698181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  35.14 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  35.14 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0673  hypothetical protein  37.5 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 377 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  34.38 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  32.06 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0311  Endoribonuclease L-PSP  40.78 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.480909  hitchhiker  0.000163264 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6257  endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5523  endoribonuclease L-PSP  25.95 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.684308  normal  0.107596 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04115  predicted mRNA endoribonuclease  32.59 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2487  Endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4820  endoribonuclease L-PSP family protein  32.59 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04079  hypothetical protein  32.59 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>