More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2408 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  257  5.0000000000000005e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  58.73 
 
 		 133 aa  156  8e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  61.42 
 
 		 132 aa  147  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  57.26 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2457  endoribonuclease L-PSP  60 
 
 		 133 aa  140  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  56.8 
 
 		 122 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12719  hypothetical protein  56.35 
 
 		 142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  52.85 
 
 		 128 aa  137  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2183  endoribonuclease L-PSP  55.2 
 
 		 122 aa  136  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.130021  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2229  endoribonuclease L-PSP  55.2 
 
 		 122 aa  136  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3231  Endoribonuclease L-PSP  56.45 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3942  endoribonuclease L-PSP  56 
 
 		 138 aa  130  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5323  Endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 131 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.154114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1302  endoribonuclease L-PSP  52.1 
 
 		 127 aa  130  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0172337  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  60.19 
 
 		 205 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  56.9 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1345  Endoribonuclease L-PSP  49.58 
 
 		 126 aa  124  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000129455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 129 aa  120  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1439  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.534154  normal  0.776942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5724  Endoribonuclease L-PSP  51.2 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  47.2 
 
 		 131 aa  115  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1454  endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6374  endoribonuclease L-PSP  48.76 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6914  endoribonuclease L-PSP  46.67 
 
 		 132 aa  114  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1710  endoribonuclease L-PSP  45.83 
 
 		 121 aa  114  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2372  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675716  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2914  hypothetical protein  44.63 
 
 		 135 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0283719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3052  endoribonuclease L-PSP  46.9 
 
 		 130 aa  104  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2335  endoribonuclease L-PSP  46.03 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3029  endoribonuclease L-PSP  47.24 
 
 		 126 aa  100  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  41.09 
 
 		 134 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  42.98 
 
 		 129 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 		 127 aa  97.1  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4440  endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 		 142 aa  97.1  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.286195  normal  0.317631 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  44.35 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2660  endoribonuclease L-PSP  43.85 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.680061  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  43.08 
 
 		 129 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2449  putative endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2709  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0237  hypothetical protein  38.1 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0910567  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0736  putative endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 204 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0904  hypothetical protein  38.1 
 
 		 204 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0722  putative endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 204 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0473257  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2369  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 204 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.328969  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  45.45 
 
 		 480 aa  90.9  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3085  Endoribonuclease L-PSP  44 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000387773  hitchhiker  0.0000202811 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4550  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326313  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  39.29 
 
 		 113 aa  87.8  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1223  YjgF family translation initiation inhibitor  42.74 
 
 		 124 aa  87  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2884  endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  42.74 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05841  YjgF family translation initiation inhibitor  36.72 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  43.44 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5545  Endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 126 aa  83.6  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1524  endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 		 121 aa  83.6  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.348757  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  41.8 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  41.35 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06141  YjgF family translation initiation inhibitor  34.88 
 
 		 130 aa  82.8  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.617188  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0558  endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0908554  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1528  endoribonuclease L-PSP  41.09 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  38.21 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2263  endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3749  endoribonuclease L-PSP  38.66 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0521312  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  41.96 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0935  Endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.013115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08201  putative translation initiation inhibitor, yjgF family protein  38.58 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  40.54 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  36.21 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  39.66 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06221  YjgF family translation initiation inhibitor  32.8 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4692  endoribonuclease L-PSP  37.01 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  33.33 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  35.88 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0965  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1878  endoribonuclease L-PSP  32.43 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  30.33 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1888  endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  32.79 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1191  endoribonuclease L-PSP  36.64 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06131  YjgF family translation initiation inhibitor  34.86 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.479171 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  31.75 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>