More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3267 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 138 aa  287  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  93.48 
 
 		 145 aa  276  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  93.48 
 
 		 145 aa  274  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  92.75 
 
 		 145 aa  274  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  92.75 
 
 		 145 aa  274  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  90.58 
 
 		 149 aa  270  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  94.07 
 
 		 140 aa  270  7e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  94.07 
 
 		 140 aa  270  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6043  endoribonuclease L-PSP  90.58 
 
 		 145 aa  266  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143152  hitchhiker  0.000408683 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  90.58 
 
 		 145 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  90.58 
 
 		 145 aa  263  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  88.89 
 
 		 144 aa  261  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  86.67 
 
 		 138 aa  256  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  88.15 
 
 		 139 aa  256  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  86.67 
 
 		 138 aa  255  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  85.19 
 
 		 138 aa  253  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  85.82 
 
 		 145 aa  251  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  82.09 
 
 		 136 aa  244  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  85.94 
 
 		 130 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  67.67 
 
 		 140 aa  188  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  65.19 
 
 		 140 aa  188  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  64.71 
 
 		 149 aa  185  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  62.22 
 
 		 137 aa  179  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2576  endoribonuclease L-PSP  60.15 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  53.68 
 
 		 138 aa  152  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  43.8 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  36.09 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  37.74 
 
 		 135 aa  73.2  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  30.77 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  30.77 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  41.28 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  36.94 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  37.27 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  40.38 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 394 aa  63.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 118 aa  63.5  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  30.28 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  27.69 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  36.63 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  32.63 
 
 		 113 aa  62  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  29.36 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  34.86 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  36.94 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  37.61 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  34.26 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3818  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515952  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  40.21 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  37.63 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3553  endoribonuclease L-PSP  41.11 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0414  Endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  33.33 
 
 		 402 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  31.73 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  35.4 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 133 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  30.63 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  32.14 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  32.41 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  49.23 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  30.91 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  37.27 
 
 		 126 aa  57  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  28.26 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2477  endoribonuclease L-PSP family protein  34.55 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395896  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>