More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2738 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 134 aa  276  9e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  66.92 
 
 		 134 aa  181  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  66.92 
 
 		 134 aa  181  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  66.92 
 
 		 134 aa  181  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  36.15 
 
 		 148 aa  85.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  36.96 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  40.34 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  39.69 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  44.62 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  35.61 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  36.64 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  36.64 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2275  endoribonuclease L-PSP  45.31 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.321934  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  36.64 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  36.64 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  37.12 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2969  Endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0382  endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395966  normal  0.101256 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3074  Endoribonuclease L-PSP  40.32 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  33.83 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2881  endoribonuclease L-PSP  38.71 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1441  Endoribonuclease L-PSP  37.21 
 
 		 137 aa  70.5  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  35.51 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  37.01 
 
 		 135 aa  70.1  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  36.75 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1158  endoribonuclease L-PSP  36.8 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  32.86 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  32.82 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2405  endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.996899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  27.69 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  31.88 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  36.92 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  27.69 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  27.69 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  27.69 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  29.23 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  38 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  29.23 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  29.55 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  27.69 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4539  endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293828  normal  0.437318 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  27.69 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  27.69 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  27.69 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  27.69 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  26.15 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  31.06 
 
 		 131 aa  60.1  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  29.2 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  28.46 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0370  Endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  34.75 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1661  Endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  31.73 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6797  Endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  28.46 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1787  endoribonuclease L-PSP  28.24 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  41.67 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  37.06 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1993  hypothetical protein  37.8 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0722461  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  29.58 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1769  Endoribonuclease L-PSP  34.06 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.261309 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  26.15 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2156  Endoribonuclease L-PSP  31.06 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  39.33 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  29.13 
 
 		 141 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  31.43 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>