More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3297 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 127 aa  253  5e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  47.24 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  41.86 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  42.4 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  37.01 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4539  endoribonuclease L-PSP  38.06 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293828  normal  0.437318 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  41.27 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  37.3 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2487  Endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3080  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0669156  normal  0.0908777 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  36.03 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  36.29 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6797  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  37.12 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2843  Endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2673  Endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0780712 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  37.88 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  39.55 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  39.53 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  36.72 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  36.72 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2275  endoribonuclease L-PSP  40.46 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.321934  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5521  Endoribonuclease L-PSP  37.31 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5273  endoribonuclease L-PSP  36.5 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1441  Endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5894  Endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151505  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  28.33 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3363  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188913  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1158  endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540125 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6135  endoribonuclease L-PSP  37.9 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  33.85 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2178  endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1385  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  38.14 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1302  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6528  endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2689  hypothetical protein  33.07 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980036 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  36.76 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  38.4 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1589  endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  hitchhiker  0.00909657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2367  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0382  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.395966  normal  0.101256 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2016  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 131 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0910058  normal  0.042718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  36.03 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  36.03 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  37.88 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  36.03 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1030  Endoribonuclease L-PSP  40.5 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308966  normal  0.703887 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  35.45 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3120  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 116 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  41.54 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0498  endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0754281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7050  endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  31.43 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2117  Endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.413824 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1464  endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.643404  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  33.65 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  40.91 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  30.23 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6580  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121518  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  28.24 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  31.09 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2378  endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>