161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2673 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2673  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 134 aa  250  5.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0780712 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  40.46 
 
 		 135 aa  102  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  37.6 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  41.86 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  29.6 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2487  Endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  29.6 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  29.6 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  28.8 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1464  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.643404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  28 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  28 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  39.1 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  35.61 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  28 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  26.4 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  38.35 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  40.38 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  30.66 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  30.6 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  38.97 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  36.23 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0311  Endoribonuclease L-PSP  44.12 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.480909  hitchhiker  0.000163264 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  35.58 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  43.64 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  34.92 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6797  Endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 136 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 144 aa  50.4  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0973  hypothetical protein  30.3 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  35.82 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  35.82 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  35.82 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  33.65 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2796  Endoribonuclease L-PSP  31.54 
 
 		 129 aa  50.1  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.909637  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  37.12 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  33.65 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  31.73 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2275  endoribonuclease L-PSP  36.15 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.321934  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0101  endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 133 aa  49.7  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000469691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  31.73 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  33.58 
 
 		 135 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3242  endoribonuclease L-PSP  37.74 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57366  normal  0.136593 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  31.73 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  31.21 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  29.81 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  29.81 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  33.65 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  31.21 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3401  Endoribonuclease L-PSP  29.69 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00168089  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  33.65 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1441  Endoribonuclease L-PSP  31.82 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  34.59 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2156  Endoribonuclease L-PSP  28.91 
 
 		 131 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1188  endoribonuclease L-PSP  33.1 
 
 		 175 aa  47.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3051  endoribonuclease L-PSP  29.31 
 
 		 132 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  33.65 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  29.6 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2914  Endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000821115  hitchhiker  0.0000516213 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  30.77 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0647  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  34.09 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  26.56 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 136 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7050  endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 132 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  37.78 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6580  endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121518  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2269  Endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1208  putative endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  29.32 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  39.05 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0810  endoribonuclease L-PSP  29.6 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0324  endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  31.76 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3120  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  32.67 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  33.05 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  36.26 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  33.05 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  33.05 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>