More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0324 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0324  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 132 aa  263  8e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0386  endoribonuclease L-PSP  89.17 
 
 		 132 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  70.18 
 
 		 133 aa  154  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0973  hypothetical protein  56.35 
 
 		 136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2796  Endoribonuclease L-PSP  61.54 
 
 		 129 aa  143  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.909637  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0311  Endoribonuclease L-PSP  71.29 
 
 		 135 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.480909  hitchhiker  0.000163264 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13810  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  64.42 
 
 		 135 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  44.12 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0820  Endoribonuclease L-PSP  39.1 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  43.7 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  38.1 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  44.25 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6797  Endoribonuclease L-PSP  46.22 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  44.14 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  35.48 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2269  Endoribonuclease L-PSP  46.6 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  42.86 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  31.82 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  39.05 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  40.95 
 
 		 124 aa  67  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  40.71 
 
 		 148 aa  67  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4052  Endoribonuclease L-PSP  39.13 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  36.72 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  33.04 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  38.64 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  37.07 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  38.79 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  41.18 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  32.69 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  42.57 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  40.17 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  42.57 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  40.52 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  32.17 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  39.42 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  39.64 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  39.32 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  34.78 
 
 		 158 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05500  conserved hypothetical protein  36.27 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.000381478  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  34.56 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  37.8 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  26.5 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  32.48 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  39.42 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  38.39 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  34.26 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  40.2 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  40.19 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  34.26 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  32.82 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  52.63 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0673  hypothetical protein  43.14 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  36.63 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  34.31 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  35.58 
 
 		 377 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 128 aa  57  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0370  Endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1661  Endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3032  endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  33.01 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  36.54 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  35.58 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  32.08 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  35.58 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>