180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0973 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0973  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  270  7e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2796  Endoribonuclease L-PSP  75.97 
 
 		 129 aa  201  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.909637  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13810  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  77.78 
 
 		 135 aa  192  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  61.24 
 
 		 133 aa  161  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0324  endoribonuclease L-PSP  54.7 
 
 		 132 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0311  Endoribonuclease L-PSP  53.91 
 
 		 135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.480909  hitchhiker  0.000163264 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0386  endoribonuclease L-PSP  54.24 
 
 		 132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  38.71 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4052  Endoribonuclease L-PSP  40.31 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  35.9 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0820  Endoribonuclease L-PSP  36.15 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  30.51 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  32.48 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  38 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  34.56 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  35.24 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5596  Endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.87435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6797  Endoribonuclease L-PSP  35.88 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  33.01 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  33.01 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  31.43 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  32.35 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  26.72 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2269  Endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 139 aa  53.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  27.56 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1441  Endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  27.56 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1670  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.518746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  29.57 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  27.56 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  30.88 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  28.35 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  32.35 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  33.82 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0196  Endoribonuclease L-PSP  36.57 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  28.7 
 
 		 131 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  28.97 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  33.98 
 
 		 124 aa  50.1  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1357  Endoribonuclease L-PSP  31.68 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  28.7 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  31.43 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  37.62 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  28.91 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  28.7 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  28.97 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5894  Endoribonuclease L-PSP  30.58 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151505  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  31.07 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  31.03 
 
 		 131 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  36.63 
 
 		 128 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0370  Endoribonuclease L-PSP  36.67 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5379  isochorismatase hydrolase/endoribonuclease L-PSP  35.58 
 
 		 377 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.126224  normal  0.59456 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  29.81 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1443  YjgF-like protein  31.07 
 
 		 124 aa  47  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00280255  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 158 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2367  endoribonuclease L-PSP  35.58 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0101  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000469691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  31.68 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  31.65 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3401  Endoribonuclease L-PSP  29.91 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00168089  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  34.74 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  29.7 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2914  Endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000821115  hitchhiker  0.0000516213 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  34.62 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03190  lipoprotein  29.13 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  29.31 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  27.45 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1814  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  29 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  26.72 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3922  endoribonuclease L-PSP  31.43 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3510  YjgF-family lipoprotein  35.09 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.14391 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>