135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4052 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4052  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 130 aa  252  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  43.85 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0820  Endoribonuclease L-PSP  42.5 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2796  Endoribonuclease L-PSP  43.48 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.909637  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0973  hypothetical protein  40.31 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0370  Endoribonuclease L-PSP  37.31 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5064  Endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.798098  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0311  Endoribonuclease L-PSP  40.95 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.480909  hitchhiker  0.000163264 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  37.84 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5535  Endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261772  normal  0.030433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0386  endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13810  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  38.24 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.368894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1769  Endoribonuclease L-PSP  41.28 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.261309 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0324  endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  34.88 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4268  Endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0107322  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  31.2 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  31.2 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  31.2 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 185 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  32.58 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  35.51 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2176  endoribonuclease L-PSP  28.7 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589076  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  27.27 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  29.31 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2499  endoribonuclease L-PSP  35.34 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2914  Endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 142 aa  50.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000821115  hitchhiker  0.0000516213 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2440  endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.863509  normal  0.289698 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2495  Endoribonuclease L-PSP  32.69 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.628081  normal  0.767882 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  31.25 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2995  endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  28.85 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3493  Endoribonuclease L-PSP  33.65 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0453  endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2275  endoribonuclease L-PSP  36.54 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.321934  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  31.07 
 
 		 133 aa  47  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4224  endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300025  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4290  endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.905721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4602  endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.343711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1385  endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.246518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  36.26 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  36.26 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3401  Endoribonuclease L-PSP  31.73 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00168089  normal  0.0966279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  31.06 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2931  endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  30.77 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  30.09 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4539  endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293828  normal  0.437318 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  30.36 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  30.7 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_003296  RS04775  putative transmembrane protein  35.4 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05662  hypothetical protein  35.4 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1208  putative endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  32.08 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3477  endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 386 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.281015  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 158 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  35.19 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  28.91 
 
 		 125 aa  43.9  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  29.06 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0931  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000470161  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  30.48 
 
 		 130 aa  43.5  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  33.06 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3051  endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 132 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0416  endoribonuclease L-PSP  29.2 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0920711 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  26.55 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  31.62 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  28.3 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11062  L-PSP endoribonuclease family protein Brt1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03780)  28.57 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174347  normal  0.127035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  30.09 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  33.33 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3010  Endoribonuclease L-PSP  31.54 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  25.19 
 
 		 132 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  30.25 
 
 		 135 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  29.23 
 
 		 143 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02087  hypothetical protein  30.17 
 
 		 126 aa  41.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4584  endoribonuclease L-PSP  22.9 
 
 		 127 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0241713  unclonable  0.0000000230833 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  31.01 
 
 		 125 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  34.75 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2156  Endoribonuclease L-PSP  29.81 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>