264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4662 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4662  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 185 aa  378  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4539  endoribonuclease L-PSP  52.59 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293828  normal  0.437318 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0682  Endoribonuclease L-PSP  43.45 
 
 		 161 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.083858 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4718  Endoribonuclease L-PSP  49.63 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  45.39 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0717  Endoribonuclease L-PSP  44.37 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2275  endoribonuclease L-PSP  51.52 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.321934  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2252  endoribonuclease L-PSP  47.69 
 
 		 140 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3522  endoribonuclease L-PSP  47.69 
 
 		 140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0348507  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  47.24 
 
 		 148 aa  106  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2176  endoribonuclease L-PSP  43.61 
 
 		 151 aa  104  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589076  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  42.64 
 
 		 133 aa  96.3  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2405  endoribonuclease L-PSP  47.69 
 
 		 136 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.996899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0647  endoribonuclease L-PSP  41.94 
 
 		 137 aa  96.7  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1188  endoribonuclease L-PSP  40.43 
 
 		 175 aa  95.5  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3498  L-PSP family endoribonuclease  41.53 
 
 		 154 aa  87.4  9e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.23917  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 134 aa  77.4  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  37.69 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  32.89 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  34.35 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  34.35 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  34.35 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  34.4 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  34.33 
 
 		 131 aa  67  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3601  endoribonuclease L-PSP, putative  35.82 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2710  putative endoribonuclease L-PSP  33.6 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  32.28 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3101  Endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  33.91 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2433  endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000161475  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 127 aa  60.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6797  Endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3242  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57366  normal  0.136593 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3035  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2796  Endoribonuclease L-PSP  29.06 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.909637  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  31.54 
 
 		 133 aa  57  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1589  endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 		 130 aa  57.8  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  hitchhiker  0.00909657 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  37.38 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1441  Endoribonuclease L-PSP  29.23 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  37.25 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  33.58 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1302  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6528  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6135  endoribonuclease L-PSP  36.13 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  35.24 
 
 		 136 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 		 144 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  31.39 
 
 		 135 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 127 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0973  hypothetical protein  26.72 
 
 		 136 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1663  endoribonuclease L-PSP  28.03 
 
 		 142 aa  54.3  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  34.07 
 
 		 136 aa  53.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7050  endoribonuclease L-PSP  35.83 
 
 		 132 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.130103 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 129 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  27.07 
 
 		 132 aa  53.1  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  36.27 
 
 		 128 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6295  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 130 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114963  hitchhiker  0.00251827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  32.84 
 
 		 137 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4052  Endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 130 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2117  Endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 137 aa  52.8  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.413824 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6580  endoribonuclease L-PSP  35.29 
 
 		 130 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.121518  normal  0.64556 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  32.69 
 
 		 131 aa  52.4  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  30.36 
 
 		 142 aa  52  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  30.23 
 
 		 135 aa  51.6  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  35.92 
 
 		 131 aa  51.6  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3818  endoribonuclease L-PSP  35.64 
 
 		 135 aa  51.6  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515952  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  34.29 
 
 		 140 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  34.29 
 
 		 140 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  39.42 
 
 		 131 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2673  Endoribonuclease L-PSP  33.72 
 
 		 134 aa  51.2  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0780712 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  31.43 
 
 		 131 aa  51.2  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2367  endoribonuclease L-PSP  35.62 
 
 		 134 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2736  endoribonuclease L-PSP  33.66 
 
 		 138 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5273  endoribonuclease L-PSP  37.06 
 
 		 134 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0351  endoribonuclease L-PSP  30.7 
 
 		 132 aa  50.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000170484  normal  0.265808 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  30.36 
 
 		 131 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4018  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 131 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693135  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3954  Endoribonuclease L-PSP  34.26 
 
 		 129 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  30.63 
 
 		 138 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  30.56 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  32.08 
 
 		 149 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  35.58 
 
 		 145 aa  50.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 132 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  30.56 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 		 138 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 134 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 130 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0386  endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 132 aa  49.3  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0244583 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2881  endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 136 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 131 aa  49.7  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>