More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6423 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 145 aa  301  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 145 aa  301  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  99.31 
 
 		 145 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  98.62 
 
 		 145 aa  299  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  96.53 
 
 		 149 aa  295  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  94.93 
 
 		 140 aa  279  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  94.93 
 
 		 140 aa  279  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6043  endoribonuclease L-PSP  88.97 
 
 		 145 aa  276  9e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143152  hitchhiker  0.000408683 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  92.75 
 
 		 138 aa  274  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  89.93 
 
 		 144 aa  273  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  87.59 
 
 		 145 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  87.59 
 
 		 145 aa  270  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  86.76 
 
 		 138 aa  258  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  88.15 
 
 		 139 aa  257  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  85.93 
 
 		 138 aa  256  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  85.19 
 
 		 145 aa  253  8e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  84.44 
 
 		 138 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  83.58 
 
 		 136 aa  249  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  85.16 
 
 		 130 aa  240  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  64.71 
 
 		 140 aa  189  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1663  Endoribonuclease L-PSP  64.93 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0376  Endoribonuclease L-PSP  63.24 
 
 		 149 aa  184  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  59.26 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2576  endoribonuclease L-PSP  63.91 
 
 		 139 aa  171  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.289994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3456  endoribonuclease L-PSP  54.81 
 
 		 138 aa  152  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.962591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1855  endoribonuclease L-PSP  45.99 
 
 		 141 aa  133  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.570502  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  36.09 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 136 aa  67  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2496  endoribonuclease, inhibits protein synthesis  34.91 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.591272  normal  0.661186 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2299  Endoribonuclease L-PSP  43.27 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0512  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3547  hypothetical protein  33.68 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.7424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1821  endoribonuclease L-PSP  30.28 
 
 		 132 aa  64.7  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.589735 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3991  Endoribonuclease L-PSP  37.74 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79301  normal  0.524999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  37.14 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  30.56 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  27.69 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2099  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 394 aa  63.5  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0409826  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4670  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  27.69 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  27.69 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2374  endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  36.04 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  36.11 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  33.03 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  28.85 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6151  3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase and related beta-hydroxyacid dehydrogenase-like protein  36.84 
 
 		 402 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0200858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  37.61 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  35.96 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2738  endoribonuclease L-PSP  27.69 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.122458  normal  0.0788875 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1773  Endoribonuclease L-PSP  30.91 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00826992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  33.94 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  27.52 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4240  endoribonuclease L-PSP  34.91 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.209705 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11062  L-PSP endoribonuclease family protein Brt1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03780)  35.48 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.174347  normal  0.127035 
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  33.94 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  30.56 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  30.56 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  32.08 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  34.58 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 126 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3818  endoribonuclease L-PSP  33.94 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.515952  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0853  endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.287208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3553  endoribonuclease L-PSP  37.89 
 
 		 159 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  34.86 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  31.18 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3938  Endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.014328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  31.48 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0836  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.496581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3867  endoribonuclease L-PSP  29.52 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5597  Endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0561  endoribonuclease L-PSP  30.48 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  32.98 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2374  endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553105 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2862  endoribonuclease L-PSP  30.84 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337398  normal  0.332588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5525  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  31.78 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0668  endoribonuclease L-PSP  29.41 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6077  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70010  hypothetical protein  33.33 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  30.11 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1115  putative translation initiation inhibitor  35.9 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>