More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4884 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 142 aa  286  7e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  56.15 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  60.32 
 
 		 142 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4018  endoribonuclease L-PSP  52.31 
 
 		 131 aa  148  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693135  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  51.16 
 
 		 130 aa  147  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2117  Endoribonuclease L-PSP  51.94 
 
 		 137 aa  147  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.413824 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4074  endoribonuclease L-PSP  53.44 
 
 		 132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0498  endoribonuclease L-PSP  53.12 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0754281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  53.49 
 
 		 132 aa  144  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2689  hypothetical protein  51.11 
 
 		 148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980036 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  52.71 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  51.97 
 
 		 131 aa  144  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  51.18 
 
 		 131 aa  144  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  50.78 
 
 		 134 aa  141  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  51.16 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  50.39 
 
 		 131 aa  140  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  52.71 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1589  endoribonuclease L-PSP  51.16 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  hitchhiker  0.00909657 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5093  endoribonuclease L-PSP  49.61 
 
 		 132 aa  135  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  49.61 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  50.76 
 
 		 137 aa  132  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  46.92 
 
 		 131 aa  131  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  49.24 
 
 		 134 aa  130  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 131 aa  130  5e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2178  endoribonuclease L-PSP  49.25 
 
 		 136 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  49.22 
 
 		 130 aa  129  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  49.22 
 
 		 130 aa  129  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  48.82 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  41.54 
 
 		 133 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1397  Endoribonuclease L-PSP  40.88 
 
 		 176 aa  104  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.492198  decreased coverage  0.000402676 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  40.77 
 
 		 133 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 133 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  43.08 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5521  Endoribonuclease L-PSP  44.78 
 
 		 134 aa  97.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  39.53 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  38.98 
 
 		 132 aa  73.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  37.59 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6178  hypothetical protein  42.2 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71200  YjgF family translation initiation inhibitor  42.2 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3031  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00544929  normal  0.808496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  36.23 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  36.03 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3267  endoribonuclease L-PSP  41.28 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.431089  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5405  endoribonuclease L-PSP  40.37 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0585911 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  26.56 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 139 aa  68.9  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3227  endoribonuclease L-PSP  40.98 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.841476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6992  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2843  Endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5674  endoribonuclease L-PSP  40.37 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.171739  normal  0.201016 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  36.76 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6423  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.954317 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7080  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0944873 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  35.07 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  39.09 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0234  Endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  35.14 
 
 		 136 aa  66.6  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  34.56 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  31.54 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  33.96 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2347  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.977249 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  32.56 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  32.11 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  33.33 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  34.85 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  33.33 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  37.4 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2200  endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.162776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  31.25 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1777  endoribonuclease L-PSP  32.31 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  34.21 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  39.66 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2595  endoribonuclease L-PSP  31.75 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6043  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143152  hitchhiker  0.000408683 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4213  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.381709  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3574  endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1847  endoribonuclease L-PSP, putative  34.91 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0496  endoribonuclease L-PSP  31.86 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000921293  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2506  endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0850215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2172  endoribonuclease L-PSP  39.82 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219438  hitchhiker  0.00143266 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2691  endoribonuclease L-PSP  30.3 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65572  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  37.61 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4365  endoribonuclease L-PSP  34.43 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  32.06 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  37.86 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>