179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1397 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1397  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 176 aa  347  4e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.492198  decreased coverage  0.000402676 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  53.08 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5521  Endoribonuclease L-PSP  48.87 
 
 		 134 aa  111  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  40.88 
 
 		 142 aa  104  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  39.06 
 
 		 143 aa  97.8  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  38.17 
 
 		 131 aa  92  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  35.66 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4018  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693135  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  34.45 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2117  Endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.413824 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  35.94 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  36.43 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  35.16 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  32.81 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  37.5 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  39.62 
 
 		 134 aa  70.5  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  31.5 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4074  endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  32.03 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2178  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  29.46 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  35.38 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  27.91 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  31.11 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  35 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4894  endoribonuclease L-PSP  34.71 
 
 		 134 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.657922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 		 142 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  35.61 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  35.61 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  35.61 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5093  endoribonuclease L-PSP  29.23 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  29.32 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1589  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  hitchhiker  0.00909657 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0498  endoribonuclease L-PSP  30 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0754281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1787  endoribonuclease L-PSP  29.1 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  30.4 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2891  Endoribonuclease L-PSP  37.17 
 
 		 132 aa  58.2  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0848604  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4178  endoribonuclease L-PSP  32.33 
 
 		 136 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.18793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  28.8 
 
 		 131 aa  57  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0767  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0528895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3572  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.800436  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4795  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  35.56 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5488  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236112 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1171  endoribonuclease L-PSP  29.36 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4700  endoribonuclease L-PSP  31.58 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0915  endoribonuclease L-PSP  29.5 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  34.19 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  33.08 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  33.59 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2487  Endoribonuclease L-PSP  40.31 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2689  hypothetical protein  28.57 
 
 		 148 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 131 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 131 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4587  endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 134 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  31.19 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1252  Endoribonuclease L-PSP  30.28 
 
 		 128 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34570  putative translation initiation inhibitor, yjgF family  32.09 
 
 		 136 aa  52  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00491284  normal  0.846357 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2982  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 123 aa  52  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1301  endoribonuclease L-PSP  28.24 
 
 		 130 aa  51.2  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  33.62 
 
 		 145 aa  51.2  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0684  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 131 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4936  endoribonuclease L-PSP  31.39 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1118  endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140871  normal  0.1168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2898  Endoribonuclease L-PSP  31.11 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.399725  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6797  Endoribonuclease L-PSP  29.55 
 
 		 136 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.674674  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2467  endoribonuclease L-PSP  29.63 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000783764  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3297  Endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 127 aa  48.9  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.815851  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  30.3 
 
 		 135 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  31.9 
 
 		 145 aa  48.5  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5477  endoribonuclease L-PSP  39.56 
 
 		 128 aa  48.5  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3993  Endoribonuclease L-PSP  36 
 
 		 127 aa  48.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.655583 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  28.26 
 
 		 131 aa  48.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2378  endoribonuclease L-PSP  28.68 
 
 		 151 aa  48.1  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0282  Endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 		 128 aa  48.1  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0662893  normal  0.101063 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 126 aa  47.8  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3876  Endoribonuclease L-PSP  28.44 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.873675  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2099  Endoribonuclease L-PSP  34.33 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  29.31 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7869  Endoribonuclease L-PSP  34.29 
 
 		 134 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2881  endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0900  hypothetical protein  32.54 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  28.8 
 
 		 145 aa  47  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0617  Endoribonuclease L-PSP  26.52 
 
 		 131 aa  46.6  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  29.66 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6043  endoribonuclease L-PSP  31.03 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0143152  hitchhiker  0.000408683 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  28.89 
 
 		 131 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3893  Endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 		 134 aa  45.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  28.89 
 
 		 131 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2452  endoribonuclease L-PSP  28.36 
 
 		 131 aa  45.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.519847  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1711  endoribonuclease L-PSP  28.42 
 
 		 130 aa  45.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.38982  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2669  Endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 133 aa  45.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1027  Endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 		 131 aa  45.1  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.84839  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  28.68 
 
 		 155 aa  45.1  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>