More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4074 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4074  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 132 aa  267  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0276  putative aerobic 2-aminobenzoate  81.54 
 
 		 131 aa  219  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7162  Endoribonuclease L-PSP  81.54 
 
 		 131 aa  219  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0743912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3169  endoribonuclease L-PSP  57.48 
 
 		 130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4018  endoribonuclease L-PSP  57.69 
 
 		 131 aa  158  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.693135  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02014  hypothetical protein  57.48 
 
 		 130 aa  158  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3951  Endoribonuclease L-PSP  58.27 
 
 		 130 aa  157  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0816657 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3838  Endoribonuclease L-PSP  58.27 
 
 		 130 aa  157  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.481327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1589  endoribonuclease L-PSP  56.69 
 
 		 130 aa  154  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  hitchhiker  0.00909657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5043  Endoribonuclease L-PSP  56.82 
 
 		 132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2117  Endoribonuclease L-PSP  56.69 
 
 		 137 aa  152  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.413824 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2280  endoribonuclease L-PSP  56.69 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5093  endoribonuclease L-PSP  57.69 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.552883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4466  endoribonuclease L-PSP  56.49 
 
 		 134 aa  150  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136863 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0498  endoribonuclease L-PSP  56.69 
 
 		 130 aa  147  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0754281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4884  Endoribonuclease L-PSP  53.44 
 
 		 142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0746987 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2480  endoribonuclease L-PSP  55.12 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0823  endoribonuclease L-PSP  51.94 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3623  endoribonuclease L-PSP  51.18 
 
 		 131 aa  140  8e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1200  Endoribonuclease L-PSP  53.6 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2196  endoribonuclease L-PSP  49.62 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0707908  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0587  endoribonuclease L-PSP  48.8 
 
 		 131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2689  endoribonuclease L-PSP  53.6 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3130  Endoribonuclease L-PSP  51.18 
 
 		 131 aa  133  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2689  hypothetical protein  51.18 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980036 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2231  endoribonuclease L-PSP  47.33 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2178  endoribonuclease L-PSP  48.06 
 
 		 136 aa  127  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1330  endoribonuclease L-PSP  44.62 
 
 		 134 aa  118  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.805737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2924  Endoribonuclease L-PSP  43.41 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2865  endoribonuclease L-PSP  40.31 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.16949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2607  endoribonuclease L-PSP  40.31 
 
 		 133 aa  94.4  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.171659  hitchhiker  0.00292827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0304  Endoribonuclease L-PSP  38.64 
 
 		 143 aa  90.5  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.4542  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2159  Endoribonuclease L-PSP  38.02 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1397  Endoribonuclease L-PSP  30.95 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.492198  decreased coverage  0.000402676 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3501  hypothetical protein  32.8 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.987985  normal  0.527016 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5521  Endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3282  endoribonuclease L-PSP  36.44 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925015  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2820  Endoribonuclease L-PSP  38.46 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.678255  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  29.82 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0885  endoribonuclease L-PSP  38.79 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.60332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0958  endoribonuclease L-PSP  33.85 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.678542 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2046  L-PSP family endoribonuclease  34.86 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2780  Endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  31.3 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4365  endoribonuclease L-PSP  31.93 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4515  endoribonuclease L-PSP  32.2 
 
 		 137 aa  57  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  32.46 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4917  Endoribonuclease L-PSP  35.43 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.51623  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1346  hypothetical protein  32.03 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.703391 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0135  endoribonuclease L-PSP, putative  31.03 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00324378  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  37.72 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1053  L-PSP family endoribonuclease  37.19 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0450372  normal  0.0141038 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0604  endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.312968  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0543  L-PSP family endoribonuclease  37.19 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  30.7 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  37.62 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  29.82 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0935  Endoribonuclease L-PSP  29.69 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4019  endoribonuclease L-PSP  33.93 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.658483  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2961  endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.211045  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4166  putative endoribonuclease L-PSP  35.09 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0350  putative endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0443  endoribonuclease L-PSP  35.71 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2408  hypothetical protein  33.87 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0314271  normal  0.0494567 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4381  endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.901954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  32.32 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3465  hypothetical protein  36.36 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2388  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0012  endoribonuclease L-PSP  36.28 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2756  putative endoribonuclease L-PSP  29.32 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00188195  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1176  putative endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3612  hypothetical protein  35.43 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0531  putative endoribonuclease L-PSP  30.17 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000228568  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03649  hypothetical protein  37.72 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0518  putative endoribonuclease L-PSP  30.17 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000619405  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0365  endoribonuclease L-PSP  30.43 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4350  Endoribonuclease L-PSP  34.19 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03132  hypothetical protein  37.5 
 
 		 128 aa  52  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.433124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4194  Endoribonuclease L-PSP  36.25 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.705998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002417  endoribonuclease L-PSP  36.84 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5403  Endoribonuclease L-PSP  30.83 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.411784  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4835  endoribonuclease L-PSP  30.47 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4773  putative endoribonuclease L-PSP  31.68 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.091821  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0574  putative endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000328511  hitchhiker  0.00876549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5244  Endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 		 130 aa  52  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.677365  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4304  Endoribonuclease L-PSP  36.25 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.135988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2367  Endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2843  Endoribonuclease L-PSP  32.76 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1984  hypothetical protein  33.03 
 
 		 128 aa  51.6  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0180  endoribonuclease L-PSP  36.11 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00581457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2706  putative endoribonuclease L-PSP  29.32 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000241959 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0367  endoribonuclease L-PSP  30.69 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0362  putative endoribonuclease L-PSP  37.66 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2726  endoribonuclease L-PSP, putative  28.03 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000401402  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1989  hypothetical protein  33.03 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  34.38 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1433  Endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.652248  normal  0.596243 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  31.19 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2599  putative endoribonuclease L-PSP  28.57 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000321897 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>